キミンダ国のランプ売りの少女ジェニーが、ドクロストーンの在処を知っているとの情報が。現地へ急行したドロンボーはジェニーの養父母と会い、彼女の身柄を引き取りたいと申し出る。しかし、このおばあさんは強欲な性格をしており、これまでに彼女にかかった養育費を全部払えという。三悪もそんな話を聞くことが出来ないという両者の間で話が縺れていくうちにヤッターマンが参上。

キミンダ国のランプ売りの少女･ジェニーがドクロストーンの在処を知っているとの情報が。すかさず現地へ急行したドロンボーはジェニーの養父母と会い、彼女の身柄を引き取りたいと申し出る。しかし、このおばあさんは強欲な性格をしており、これまでに彼女にかかった養育費を全部払えという。

ガリア国のブチコメー監獄には、政府の方針に賛同しかねる反乱軍兵士が捕まっていた。兵士の中にドクロストーンのありかを知っている者がいるという。ところが監獄には仮面をつけた兵士ばかりが収められており、どの男が在処を知る者なのか判らない。自らも仮面をつけて監獄に潜入したボヤッキーは銅仮面を被った男に当たりをつけて救出するが・・・・・・。

ガリア国のブチコメー監獄には、政府の方針に賛同しかねる反乱軍兵士が捕まっていた。この兵士の中にドクロストーンの在処を知っている者がいるという。ところが監獄には仮面をつけた兵士ばかりが収められており、どの男が在処を知る者なのか判らない。

またもや宇宙へ飛んだドロンボーとヤッターマン。行き先は天の川にあるショクジョ星だ。星の王から駆け落ちした娘のオリヒメをケンギョウという男のもとから連れ帰ってきたらドクロストーンをもらえるといわれたドロンボーは、条件を呑み作戦を実行に移す。ところが娘を連れ帰っても石を渡さない王に立腹したドロンボーは、巨大メカで大暴れ。

またもや宇宙へ飛んだドロンボーとヤッターマン。行き先は天の川にあるショクジョ星だ。この星の王から駆け落ちした娘のオリヒメをケンギョウという男のもとから連れ帰ってきたらドクロストーンをもらえるといわれたドロンボーは、条件を呑み作戦を実行に移す。

三重県伊賀の国に住む忍術使いジライヤに会いに来たドロンボー。しかし、ジライヤが持っていたドクロストーンらしき石は彼の師匠に取り上げられてしまっていたとのこと。三悪はジライヤと一緒に師匠から石を取り戻そうとする。だが、ジライヤの娘のカスミの説得によって、ジライヤは改心する。実はこの石は忍術の免許皆伝の証であったのだが、最近忍術で悪事を働いてばかりのジライヤを許せない師匠が取り上げてしまっていたのだった。

三重県伊賀の国に住む忍術使いジライヤに会いに来たドロンボー。しかし、ジライヤが持っていたドクロストーンらしき石は彼の師匠に取り上げられてしまっていたとのこと。三悪はジライヤと一緒に師匠から石を取り戻そうとする。

ドクロベエよりローマン国王が所有しているドクロストーンを奪えとの指令を受けたドロンボー。しかし、現地に到着するや、非常に疑り深い性格の王様によってドロンジョははりつけに去れてしまう。一方その頃、ジーンという男も同様の刑に処されていた。なんでも、彼の親友のハシレメドスが母親に薬を届けて戻ってくるまで身代わりになったというのだ。しかし、三悪はこのハシレメドスを妨害する代わりに王の持つ石をもらうという取引をしてしまう。

ドクロベエよりローマン国王が所有しているドクロストーンを奪えとの指令を受けたドロンボー。しかし、現地に到着するや、非常に疑り深い性格の王様によってドロンジョははりつけに去れてしまう。ちょうど同じ頃、ジーンという男も同様の刑に処されていた。

裕福な家から盗んだお金を貧困な者に与えている義賊・ゴエモン。ゴエモンが次に狙うのはお城の蔵だ。彼は民衆が貧乏なのに贅沢な暮らしをしている殿様の事が前々から気に食わなかったのだ。ところが、同じく城の蔵にあるドクロストーンを狙っていたドロンボーはゴエモンの企みを役人に密告。そのために彼はお縄になってしまい、哀れ釜ゆでの刑に処されてしまう。

裕福な家から盗んだお金を貧困な者に与えている義賊･ゴエモン。そのゴエモンが次に狙うのはお城の蔵だ。彼は民衆が貧乏なのに贅沢な暮らしをしている殿様の事が前々から気に食わなかったのだ。

スイスイ国のリップル王子は、ショローラ姫との結婚を間近に控えていた。この婚礼で王子から姫に贈られる宝こそがドクロストーンだという。ドロンボーは宝を入手するためにかつて国を支配していた魔女と結託し、姫を永遠の眠りにつかせてしまう。そしてドロンジョは、姫を目覚めさせるには自分と結婚しろと王子を脅迫。仕方なくその要求を呑む王子だが、ドロンジョとの結婚式当日ヤッターマンが参上。

スイスイ国のリップル王子は、ショローラ姫との結婚を間近に控えていた。この婚礼で王子から姫に贈られる宝こそがドクロストーン。ドロンボーは宝を入手するためにかつて国を支配していた魔女と結託し、姫を永遠の眠りにつかせてしまう。

鉢かぶり姫の被っている鉢がドクロストーンらしいことから、ドロンボーは彼女のいるカワッチ村へ。鉢かぶり姫はその地方をおさめる中条の家で働いていた。中条の息子・末津庫は姫に求婚するも、彼の母親は猛反対。このままではお世話になった中条に迷惑がかかると判断した姫は、この家を出る決心をする。そこへ鉢を狙う三悪が彼女に襲いかかるも、ヤッターマンによって撃退されてしまう。

鉢かぶり姫の被っている鉢がドクロストーンらしいことから、ドロンボーは彼女のいるカワッチ村へ。鉢かぶり姫はその地方をおさめる中条の家で働いていた。中条の息子･末津庫は姫に求婚するも、彼の母親は猛反対。このままではお世話になった中条に迷惑がかかると判断した姫は、この家を出る決心をする。

くらい山で修行に励んでいるひよ若丸がドクロストーンを持っているとの情報をドクロベエから入手したドロンボーは、彼を訪ねて現地に参上。ドクロストーンと思わしき石のカブトは、既に暴れん坊のフンケイに奪われてしまった後だった。ヤッターマンからケンダマジックを借りたひよ若丸はフンケイを倒すも、石のカブトはドロンボーに奪われてしまう。

くらい山で修行に励んでいるひよ若丸がドクロストーンを持っているとの情報をドクロベエから入手したドロンボーは、彼を訪ねて現地に参上。ところが、ドクロストーンと思わしき石のカブトは、既に暴れん坊のフンケイに奪われてしまった後だった。

アロプス山脈でまだ誰も登ったことのないマボロスト山頂に、ドクロストーンがあるらしい。ドロンボは登山隊員の少年ミラーから彼の父親が発見したマボロスト山への地図を奪い、見事登頂に成功する。ところが、ミラーを救出したヤッターマンもドロンボーの後を追って山頂に現れた。

アロプス山脈でまだ誰も登ったことのないマボロスト山頂にドクロストーンがあるらしい。三悪は登山隊員の少年ミラーから彼の父親が発見したマボロスト山への地図を奪い、見事登頂に成功する。ところが、ミラーを救出したヤッターマンもドロンボーの後を追って山頂に現れた!

ラブランドに住む雪の女王が、ドクロストーンを持っているとの情報を聞いたドロンボー。この国では女王が国中の人々を凍らせていることで困っており、ヤッターマンが出会った少年・ケイの恋人ギルダもその一人だった。ケイはヤッターマンと共にギルダを取り戻すために女王の城に乗り込むことに。女王に心を閉ざされてしまったギルダは、彼女の刺客となってケイに襲いかかる。

ラブランドに住む雪の女王がドクロストーンを持っているとの報を聞いたドロンボー。この国では女王が国中の人々を凍らせていることで困っており、ヤッターマンが出会った少年･ケイの恋人ギルダもその一人だった。

山奥にある不加納道場に伝わる虎の巻が、ドクロストーンであるという情報を得たドロンボー。ドロンボーはアカデクサイという剣豪に道場破りさせ、虎の巻を入手しようとするがあえなく失敗。その一方で、ヤッターマンは道場の娘・みどりから、剣豪になることを夢見て道場を飛び出していった門下生・年五郎を呼び戻して欲しいと頼まれる。ヤッターマンの説得により年五郎が道場に戻ると、そこには彼の師匠である道場主がドロンボーに脅迫されていた。

山形県の山奥にある不加納道場に伝わる虎の巻がドクロストーンであるという情報を耳にしたドロンボー。三悪はアカデクサイという剣豪に道場破りさせ、虎の巻を入手しようとするもあえなく失敗。

噴火をはじめたアブリカのハレマンジャロ火山。その近くに住むシバ族がドクロストーンを持っていると聞いたドロンボー。現地に着いたドロンボーは、シバ族の人々から行方不明の酋長の妻を探して欲しいと頼まれる。女占い師に扮したドロンジョの予言を聞いた一族はさっそく探索に出かけるも、ドロンボーはその隙に酋長の家からドクロストーンを頂戴してしまう。しかし、ヤッターマンは酋長の息子であるケンと共に、ドロンボーが持ち出した石を取り戻そうとする。

アブリカのハレマンジャロ火山が噴火をはじめた。その近くに住むシバ族がドクロストーンを持っていると聞いたドロンボー。現地に着いた三悪は、シバ族の人々から行方不明の酋長の妻を探して欲しいと頼まれる。

キョウトン国のゴショウ村にあるらしょう門に住んでいる鬼が、ドクロストーンを持っていると聞いたドロンボー。鬼を呼び出したところ、渡辺綱と名乗る侍にその腕を切られてしまう。ドロンボーは綱に近づき、この腕を使って再び鬼をおびき寄せる作戦を実行した。一方、ドロンボーを追ってやってきたヤッターマンは、片腕を失って悲しむ鬼と出会い、腕を取り返すのに協力することを約束する。

キョウトン国のゴショウ村にあるらしょう門に住んでいる鬼がドクロストーンを持っていると聞いたドロンボーは、現地へ出動。件の鬼を呼び出したところ、渡辺綱と名乗る侍にその腕を切られてしまう。

ドクロベエの指令によって、宇宙の彼方に浮かんでいる移動惑星へ出発したドロンボー。ヤッターマンも宇宙仕様に換装したヤッターキングと共にその後を追う。移動惑星の住民であるタコそっくりの宇宙人は地球人を快く思っておらず、惑星に到着したドロンボーやヤッターマンは有無を言わさずに捕まってしまう。しかし、流星群が惑星に接近するのをきっかけに、ドロンボーはドクロストーンらしき石をちゃっかり頂戴し、その上宇宙人の王女を連れて脱出してしまう。

ドクロベエの指令によって、宇宙の彼方に浮かんでいる移動惑星へ出発したドロンボー。ヤッターマンも宇宙仕様に換装したヤッターキングと共にその後を追う。移動惑星の住民であるタコそっくりの宇宙人は地球人を快く思っておらず、惑星に到着したドロンボーやヤッターマンは有無を言わさずに捕まってしまう。

かつて、若い娘を生け贄としてヒヒに捧げる習慣のあったイナカー村。その庄屋の娘がドクロストーンを持っているらしい。ヒヒに娘を要求されて困り果てた庄屋の前に、イヤミ重太郎なる子連れの素浪人がヒヒを倒すと名乗り出る。ところが、重太郎は本当はケンカもしたこともない見かけ倒しの男だった。結局、重太郎と一緒に戦うはずのヤッターマンは、自分たちだけでヒヒに挑むことになるのだった。

かつて、若い娘を生け贄としてヒヒに捧げる習慣のあったイナカー村。この村の庄屋の娘がドクロストーンを持っていることを知ったドロンボーは、ヒヒに扮して彼女をさらう作戦を実行。娘を要求されて困り果てた庄屋の前に、イヤミ重太郎なる子連れの素浪人がヒヒを倒すと名乗り出る。

オビ砂漠を旅する四蔵法師が、ドクロストーンのありかを知っているというドクロベエの情報を受けたドロンボー。四蔵のボディガードである孫六空たちを騙して妖怪にさらわせてしまい、その代わりに自分達が四蔵の護衛についてしまうドロンボー。ヤッターマンは孫六空たちを救い出すために四蔵に力を貸し、見事妖怪退治を成し遂げる。しかし、ドロンボーは四蔵の事をあきらめてはおらず、ヤッターマンに挑んできた！

オビ砂漠を旅する四蔵法師がドクロストーンの在処を知っているというドクロベエの情報を受けたドロンボーは、現地へ急行。三悪は、四蔵のボディガードである孫六空たちを騙して妖怪にさらわせてしまい、その代わりに自分達が四蔵の護衛についてしまう。

ドクロストーンのことを知っているというマンジュとスシ王を探して、ドロンボーはタンゴ村にやってきた。ドロンボは人さらいのコショウ太夫とつるんで、父親に会うために一緒に旅をしている母親からマンジュとスシ王を引き離し、2人を誘拐した。ドクロストーンの在処など知らないという2人は、コショウ太夫のもとで厳しい労働を強いられることに。一方、2人の母親を助け、事の顛末を聞いたヤッターマンは、マンジュとスシ王を助けるために太夫の館へ向かうのだった。

ドクロストーンのことを知っているというマンジュとスシ王を探して、ドロンボーはタンゴ村にやってきた。三悪は人さらいのコショウ太夫とつるんで、父親に会うために一緒に旅をしている母親からマンジュとスシ王を引き離し、2人を誘拐した。

ドロンボーはドクロストーンを求め、大西洋の海底にある幻の古代都市アタランデスにやってきた。都市の住民である海坊主たちは、自分達の王子の結婚相手を探している最中だった。タコそっくりのルックスの王子は色仕掛けで迫るドロンジョを無視し、なんとアイちゃんに求婚を迫った。プライドを深く傷つけられたドロンジョは激怒し、腹いせにヤッターマンに戦いを挑む。

ドロンボーはドクロストーンを求め、大西洋の海底にある幻の古代都市アタランデスにやってきた。この都市の住民である海坊主たちは、自分達の王子の結婚相手を探している最中だった。

映画の都・ハゲウッドにやってきたドロンボー。その目的は正義のヒーロー・ボケとルマンの敵が持っているとされるドクロストーンの奪取だ。ちょうど一同が現場に着いた頃、なんと本物の怪獣が出現したとのニュースが入り込んだ。現実とフィクションの区別が着かないボケトルマンは、その怪獣を倒しに行ってしまう。ドロンボーもまたこの怪獣の身体をくまなく探し、背中に石を発見するが・・・・・・。

映画の都･ハゲウッドにやってきたドロンボー。その目的は正義のヒーロー･ボケとルマンの敵が持っているとされるドクロストーンの奪取だ。ちょうど一同が現場に着いた頃、なんと本物の怪獣が出現したとのニュースが入った。

新しいヤッターメカ、ヤッターパンダ＆コパンダ、ヤッターブル、ヤッタードジラが登場！新メカと共にドクロストーンがあるというチュンチュク地方へやってきたヤッターマンは、舌を切られたインコを助けたお礼にお宿へ招待されるというお爺さんと出会う。このお宿こそ、ドクロストーンがあるといわれるインコのお宿だった。

ヤッターキングには新メカ･ヤッターパンダ&コパンダ、ヤッタードジラ、ヤッターブルが搭載され、ますます戦力アップ。そして一行はドクロストーンがあるというチュンチュク地方へやってきた。

カッパ河原に住んでいるカッパ一族が、ドクロストーンのありかを知っているらしいとの情報を得たドロンボー。一族の夫婦を脅して、滝壷の中にドクロストーンらしき宝が隠されていることを聞き出したドロンボー。カッパ夫婦の息子・河太郎は、両親を人質に取られてしまい、三悪に宝をとってくるよう命じられる。しかし、河太郎はカッパなのに水恐怖症だった。覚悟を決め、両親のために川底に飛び込んだ河太郎は宝を持ってくるが・・・・・・。

カッパ河原に住んでいるカッパ一族がドクロストーンの在処を知っているらしい。ドロンボーは一族の夫婦を脅して滝壷の中にドクロストーンと思わしき宝が隠されていることを知る。カッパ夫婦の息子･河太郎は、両親を人質に取られてしまい、三悪に宝をとってくるよう命じられる。

人気の美人女子プロレスラーコンビ、ピンクペアが持つチャンピオンベルトがドクロストーンという情報を受けたドロンボーは、試合会場のあるジャッポン国へやってきた。ボヤッキーとトンズラーが女子プロレスラーに化け、ピンクペアとタッグマッチを行うことになるが、覆面レスラーに扮したアイちゃんの助太刀により敗退。しかし、ピンクペアの2人はなぜかガッカリした様子。どうやら引退して普通の女の子に戻りたがっているらしい。

人気絶頂の美人女子プロレスラーコンビ、ピンクペアが持っているチャンピオンベルトがドクロストーンという情報を受けたドロンボーは彼女たちが試合を行うジャッポン国へやってきた。ボヤッキーとトンズラーが女子プロレスラーとなり、ピンクペアとタッグマッチを行うことになる。

大江戸国の大江戸村で行われているカン流島の決闘の勝者に贈られる、名刀・肘鉄。その刀掛けがドクロストーンであるという情報を得たドロンボーは、カン流島の決闘に出場する佐々木イジローと接触。一方、ヤッターマンはイジローの宿敵・宮本ムサクと出会っていた。勝負は三悪が渡した特製の刀のお陰でイジローが勝利。ドロンボーはヤッターマンとの戦いには負けはしたものの、刀掛けは死守。ところが、それは大江戸原人の頭蓋骨だった。

大江戸国の大江戸村で行われているカン流島の決闘では、その勝者に名刀“肘鉄”が贈呈される。その刀掛けがドクロストーンであるという情報を得たドロンボーは、カン流島の決闘に出場する佐々木イジローと接触。一方、ヤッターマンはイジローの宿敵･宮本ムサクと出会っていた。

凶悪な赤鯨の腹の中にドクロストーンがあるとの情報を受けて、南氷洋へ向かうドロンボー。赤鯨を発見したドロンボーは攻撃するが、片足の船長に妨害されてしまう。捕鯨船の船長であるこの男は、昔奪われた片足の仇を討とうと長年この赤鯨をつけ狙っていたのだった。だが、腹を立てたドロンボーは船長の捕鯨船を沈没させてしまった。

凶悪な赤鯨の腹の中にドクロストーンがあるという情報を受けて、ドロンボーは南氷洋へ。ターゲットの赤鯨を発見した三悪は攻撃を開始するも、片足の船長に妨害されてしまう。捕鯨船の船長であるこの男は、昔奪われた片足の仇を討とうと長年この赤鯨をつけ狙っていたのだった。

ギリマー国で、人食いライオンを倒した勇者に送られるという宝。それがドクロストーンらしい。怪力自慢のあば連坊ヒネクレスをたぶらかして、ライオン退治をさせることに成功したドロンボー。ボヤッキーの援護で人食いライオンを倒したヒネクレスは宝を手に入れるが、ドロンボーはすぐさまそれを強奪して逃走してしまう。

ギリマー国では、人食いライオンを倒した勇者に送られる宝があり、どうやらそれがドクロストーンらしい。現地へ向かったドロンボーは、怪力自慢のあば連坊ヒネクレスをたぶらかしてライオン退治をさせることに成功する。

海賊のフリント船長が宝を埋めたと言われるタカリ島に、ドクロストーンがあるとの情報が。ドロンボーはタカリ島の宝を探して漂流していた、ジルバー船長を発見する。一方、ヤッターマンは宝の地図を持っていたマンボー船長と出会う。オモッチャマを人質にしたジルバーに地図は奪われるが、さらにそれをドロンボーが強奪してしまった。

海賊フリント船長が宝を埋めたとされるタカリ島にドクロストーンがあるらしい。現地へ向かう途中、ドロンボーは同じくタカリ島の宝を探して漂流していたジルバー船長を発見、救出する。一方、ヤッターマンは宝の地図を持っていたマンボー船長と出会い、行動を共にする。

人間の言葉を話というカエルを探して、ドイテ国にやってきたヤッターマンとドロンボー。しかしそこで出会ったマリ王女はカエルが大嫌いで、踏み潰してくれと言い出す。ドロンボーはカエルに近づきドクロストーンのありかを聞くが、場所を聞き出すとすぐに木に吊るしてしまった。

人間の言葉を話すカエルを探してドイテ国にやってきたヤッターマンとドロンボー。実はこのカエル、マリ王女に異様に嫌われていたのだが、ヤッターマンとドロンボーとの戦いの最中にピンチに陥った彼女を助けるために身を犠牲にした。

昔話の世界そのままの様相を見せるオトギー国。平安村に住む柿太郎が、ドクロストーンのありかを知っているという。柿太郎からドクロストーンは鬼ケ島にあるらしいと聞いたドロンボーは、彼の家来になって鬼退治に同行。柿太郎の力であっという間に鬼たちを制圧するが、実は鬼ケ島に住んでいたのは心優しい鬼たちばかりだった。

昔話の世界そのままのオトギー国の平安村に住む柿太郎がドクロストーンの在処を知っているという。柿太郎から鬼ケ島にドクロストーンがあるらしいと聞いたドロンボーは、彼の家来となって鬼退治に同行した。

オニエ山に住む盗賊の首領スッテン童子が、ドクロストーンを持っているとの情報を得たドロンボー。スッテン童子は彼が好きな月姫を連れてくれば、ドクロストーンを渡すとドロンボーと約束。姫を誘拐してきたドロンボーであったが、ドクロストーンを手に入れる直前で、ヤッターマンが現れる。

オニエ山にいる盗賊の首領スッテン童子がドクロストーンを持っているとの情報を得たドロンボーは、彼の好きな月姫を誘拐してきたらドクロストーンを譲ってもらうという取引を取り付けた。