最終回 2時間スペシャル／とある池で女性の溺死体が見つかり、榊マリコ（沢口靖子）ら科捜研メンバーが現場に臨場する。被害者は、ある町の前町長で、背中の圧迫痕から誰かに突き飛ばされた可能性があることなどが判明。さらに捜査を進めると、インターネット上には…。

第17話 マリコのジビエデート／ある小さな町で、山の斜面から転がり落ちて息絶えた厚労省の医系技官・澤部保（小松利昌）の遺体が発見される。榊マリコ（沢口靖子）らが現場に駆け付けるが、藤倉刑事部長（金田明夫）から、遺体の解剖は、この町の診療所の先生に行ってもらうよう指示が。マリコは、過疎化の進んだ町に、法医認定医がいることに驚く。

第16話 マリコ先生の実験教室／橋口呂太（渡部秀）の恩師・勝又潤子（大島さと子）が校長を務める小学校の「科学クラブ」に招かれ、特別講師として榊マリコ（沢口靖子）たち科捜研メンバーは、授業を行うことに。すると、まるで“ミニ・マリコ”のような「科学クラブ」の女子児童が、教卓の裏にテープで留められている、血液反応のある不審なハンマーを発見。

第15話 救助犬ゾイ／榊マリコ（沢口靖子）と涌田亜美（山本ひかる）は、ある山中で、動画投稿サイトで大人気のイケメン“ハンドラー＜訓練士＞”の斯波＜しば＞ 健三（奥野壮）と救助犬・ゾイのコンビ≪ゾイケン≫と出会う。健三はゾイの言葉がわかるという触れ込みで注目を集め、これまで多くの救助をゾイとともに成功させていた。

第14話 復讐する臓器／とある日の科捜研。橋口呂太（渡部秀）がにわかには信じられない様な話を始める。それは、知り合いの少年の元に、亡くなった父親の記憶を受け継いだという男が現れたというものだった。呂太に懇願され、榊マリコ（沢口靖子）は、その少年に会いに公園へと向かう。少年の父親は、大学准教授の賀茂井健治。

第13話 マリコのソロキャンプ／とあるキャンプ場で、頭部に傷を負い絶命している男性の遺体が発見される。被害者は、ソロキャンプ（＝ソロキャン）を楽しんでいた南郷朋親で、誰かに突き飛ばされ、後頭部を木に強打したことが死因らしい。また、被害者のそばにアウトドア用のコーヒーミルのハンドル部分が落ちており、ここから血液反応が…。

第12話 女優コート殺人事件／とある百貨店の商品企画部オフィスで、側頭部を殴打され絶命した女性の遺体が発見される。臨場した榊マリコ（沢口靖子）は被害者の右手から、握られていた繊維片と、なにかベトベトとする謎の付着物を採取。早速、鑑定を始めるのだった。一方で、第一発見者である企画部のスタッフに聞き込み捜査をする土門薫刑事（内藤剛志）。

第11話 デジタル舞子殺人事件／新年早々、人通りのない寂しい公園で、後頭部を強打され絶命した舞子姿の女性の遺体が発見される。臨場した榊マリコ（沢口靖子）ら科捜研メンバーは、被害者が身に着けている帯に二次元コードが印刷されているのに気づく。コードを読み取ったところ、「デジタル舞子」というサイトにつながったから驚く。

第10話 新春かくし芸鑑定／山中で、和楽器の鼓を抱えたスーツ姿の男性の遺体が見つかった。臨場した榊マリコ（沢口靖子）は、被害者の頭部に爪あとのような謎の引っかき傷が残されているのを発見する。まもなく、被害者の身元は暴力団のフロント企業社員・才賀春樹（小堀正博）と判明。

第09話 2時間スペシャル／榊マリコ（沢口靖子）と宇佐見裕也（風間トオル）は、和歌山県の山中に新設された警察病院を訪れていた。最近、遺体に捜査員のDNAが付着するなどのミスが全国的に相次いだため、開業前のその病院を借り、近畿5府県の科捜研から法医、化学の担当研究員を各1名ずつ集めて研修が行われることとなったのだ。

第08話 マリコvs殺人AI／最新鋭のAI（人工知能）を研究する“京都AIセンター”のサーバールームで、ネットニュースの記者・高階浩也（野田晋市）の遺体が見つかり、榊マリコ（沢口靖子）たち科捜研に出動要請が入った。火災通報があったため消防が急行して遺体を発見したのだが、火事の痕跡は現場にも遺体にもまったくなく…。

第07話 犯人オーディション／人気男性アイドルグループの追加メンバーを決めるオーディションの合宿場で、参加者の豊原輝（清水学）が額から血を流して死んでいるのが見つかった。臨場した榊マリコ（沢口靖子）は、被害者の口元にピンク色の繊維が数本、付着していることに気づく。また、遺体の付近には三角錐の形をした、謎のプラスチック片が転がっていた。

第06話 マリコvs鑑定王子／繁華街の裏路地にあるバーの前で、店の常連客・横井友哉（松木賢三）の刺殺体が見つかった。臨場した榊マリコ（沢口靖子）たちは、遺体のポケットからかわいらしい僧侶のキャラクターがついたキーホルダーを発見。調べたところ、京都府中部に位置する“山田村”の公式キャラクターグッズだとわかる。

第05話 殺しのエチュード／国際ピアノコンクールの日本最終予選の朝--。審査員長を務めるドイツ人女性の絞殺体が、会場のコンサートホールで見つかった。臨場した榊マリコ（沢口靖子）は、遺体の首に付着していた赤い微物を採取。また、遺体の歯の間に光る微物が挟まっているのを発見する。

第04話 マリコの靴みがき／寂れたビリヤードバーの店内で、経営者・横沢征（湯浅崇）が殺されているのが見つかった。横沢はあちこちで借金を重ねているらしく、遺体を発見したのも取り立てに来た金融業者だった。検視した榊マリコ（沢口靖子）は、横沢が薄汚れた身なりをしているにもかかわらず、靴だけがピカピカに磨き上げられていることに違和感を覚える。

第03話 マリコのラーメン大作戦／京都市内の路上で自転車が爆発し、乗っていた男性が死亡する事件が起きた。臨場した榊マリコ（沢口靖子）は、遺体を確認して驚く。被害者は大手IT企業社長・磐田誠一郎（西ノ園達大）で、マリコは先日、彼が主催する“スマホアプリコンテスト”を見学したばかりだったのだ。

第02話 殺人を消毒する女／アパートの2階で、住人・佐々浦洋子（森口幸音）の刺殺体が見つかる。隣の部屋に住む北村沙織（奥山かずさ）が一緒に飲むため訪ねたところ、遺体を発見したという。土門薫（内藤剛志）刑事は通報時間が朝9時と早く、そんな時間から飲もうとしたのか尋ねる。

第01話 マリコの選択／榊マリコ（沢口靖子）に思いがけず“異動話”が舞い込んだ。警察庁で“刑事指導連絡室”室長を務める元夫・倉橋拓也（渡辺いっけい）が、刑事講習で科学捜査を教える専門指導官に、マリコを推薦したのだ。もし選ばれたら警察庁、つまり東京に出向となる…。