萩尾（高橋克実）の妻・ゆりこ（中嶋朋子）が病院から消えた。現場に残されたコインから、萩尾は国際手配中の大泥棒“ファントムシャドウ”の仕業だとにらむが…。

車上荒らしが発生し、萩尾（高橋克実）と秋穂（榮倉奈々）は柳田（井戸田潤）を犯人として確保。柳田は犯行を認めるが、盗んだ財布を電車内で女子高生にスられたと言い…。

同じような手口の窃盗事件が連続して３件発生。萩尾（高橋克実）は錠前破りの手口から鍵福（泉谷しげる）の仕事とにらみ、秋穂（榮倉奈々）と共に鍵福を問い詰めるが…。

捜査３課と入国管理局の合同摘発で大久保（橋本じゅん）を確保した萩尾（高橋克実）。しかし、秋穂（榮倉奈々）が追ったもう１人の男（菊田大輔）が車にはねられ危篤に…。

大物政治家の個人事務所で窃盗事件が発生。萩尾（高橋克実）と秋穂（榮倉奈々）が本格的に捜査を始めようとすると、捜査３課に東京地検特捜部の藤堂（戸次重幸）が現れ…。

強盗犯が立てこもる民家に隠れる晴菜（熊田聖亜）救出のため、交渉する萩尾（高橋克実）。侵入ルートを知る可能性がある安原（滝藤賢一）から萩尾はあることを聞き出し…。

銀行強盗が民家に立てこもり、交渉を行った萩尾（高橋克実）はその相手が空き巣犯罪専門の安原（滝藤賢一）だと確信。しかし、安原は強盗はしないと言い切った萩尾は…。

頻発する事務所荒らしの手口を見て「黒蛇」と呼ばれた女泥棒を思い出す萩尾（高橋克実）。萩尾と秋穂（榮倉奈々）は捜査の中でグルメライター・鏡子（青山倫子）を知り…。

同じ手口の窃盗事件が多発。萩尾（高橋克実）が容疑者を金ヶ谷（忍成修吾）に絞って秋穂（榮倉奈々）らと調べると、捜査１課が捜査する殺人事件のあった家に辿りつき…。

３つのダイヤが盗まれた連続強盗殺人事件の捜査本部に参加した萩尾（高橋克実）と秋穂（榮倉奈々）。萩尾は独自の説を立てるが、捜査１課の菅井（設楽統）と対立し…。

警視庁捜査３課に配属された秋穂（榮倉奈々）は、強盗事件の現場で眼光鋭い１人の男を見つける。その男こそ、秋穂の上司となるベテラン刑事・萩尾（高橋克実）だった。