ミルモを倒すために、ヤシチは妖精通販で「妖精らくがきノートセット」を購入。このノートに行きたい場所の絵を描けば、その世界を自由に旅行できるのだ。これを悪用し、ヤシチはミルモをノートの世界に閉じ込めることに成功するが・・・？

今日は雪がたくさん積もっている。その景色にすっかり興奮したミルモは、妖精界から仲間たちを呼び出して大はしゃぎ。だがそんな時、雪合戦をしていたガビンが水たまりに落っこちてカゼをひき、妖精熱にうなされてしまう。

妖精新聞の記者、ワカバ・トモン・チーエの3人娘が、ミルモを取材しに来た。すっかり有頂天になってしまうミルモだったが、ヤシチとムルモはそんなミルモの態度が気に入らない。そこで二人は手を組み、魔法で取材のジャマをしようとする。

今日はいよいよバレンタインデー！ヤシチのためにチョコを用意したオトメだったが、それをなぜか結木くんが食べてしまう。しかも、そのチョコにはオトメの魔法がかけられていた。魔法の力により、結木くんは何と安純のことが好きになってしまう！

妖精学校の野球チーム「フェアリーズ」とワルモ団が、グラウンドの所有をめぐって野球の試合をすることになる。しかし、普通に戦っても勝ち目がないと判断したワルモ団は、フェアリーズの選手たちに魔法をかけ、試合に出られないようにしてしまい・・・？

リルムにプロポーズするため、キンタが人間界へやって来た。ふられてもふられてもあきらめず何度もアタックをしてくるキンタに、リルムはすっかり困り果ててしまう。そしてなぜか、リルムをめぐってミルモとキンタの間で対決が行われることに・・・。

川原で遊んでいたミルモたちは、不思議な服を着たリゲルとデネブという妖精に出会う。ミルモたちは彼らに色々と町を案内してあげるが、突然通行人たちがリゲルとデネブを見て悲鳴をあげた。・・・なぜか、彼らの姿は人間に見えているらしい！？

下校時、ひょんなことから拾った福引券で、楓たちは遊園地のペアチケットを当てる。そのチケットの権利者を公平に決めるために、ミルモはサイコロ妖精のコロロを呼び出した。この町自体を巨大なスゴロク盤とした、「妖精スゴロク」が始まる！

松竹くんの別荘がある雪山へとやって来たミルモたちだったが、猛吹雪におそわれて別荘内に閉じ込められてしまう。そんな時、ある怪事件が発生する。ミルモはこの謎を解くべく、妖精界から腕ききの名探偵（？）、テムズを呼び出した・・・。

妖精界に住むナゾの生物「ナンダカワカンナイノ」が、ある日突然大量に発生し始める。しかも妖精界だけでなく、なぜか人間界にまで・・・。これはさすがにおかしいと、原因をつきとめようとするミルモたち。何だか、ガイア族に関係があるらしいが・・・？

ヤシチのいとこ、ネズミが人間界にやって来た。ネズミのイヤミな態度がガマンならないヤシチは、今度こそミルモを倒してやろうと意気込むが、逆にやられて大ケガをしてしまう。そこでサスケとハンゾーは、ヤシチの仇を取ろうとミルモに戦いを挑む。

ついに捕えられてしまったミルモを、ドクタ博士が助けにくる。ドクタ博士はワルモ団にだまされ、メカモを悪のロボットに変えられてしまったのだという。胸についている「悪のハート回路」さえ取り外せば、メカモはいいロボットに戻るらしいが・・・？

ミルモの里の天才発明家ドクタ博士が、ミルモそっくりのロボット「メカモ」を作った。ワルモ団はこのメカモを操り、ミルモの里に攻撃をしかけてくる。しかし、妖精たちは全てミルモのしわざだと思い込み、ミルモはなぜか追われる身となってしまう・・・。

楓たちの中学校で映画の撮影が行われることになり、アイドルのキサラギリョウがやって来た。しかし、ヤシチのいたずらによりリョウがケガをしてしまい、撮影ができなくなってしまう。そこで何と、リョウにそっくりな結木くんが代役に抜てきされ・・・？

ムルモの夢の中に広がる、何とも不思議なおとぎ話ワールド。楓が川で拾った桃からムモ太郎が生まれ、結木くんが切った竹の中からリルム姫が顔を出し、しかも村人を苦しめている鬼はミルモ！？ムモ太郎は、ミルモ鬼をこらしめるべく鬼ヶ島を目指す！

いつまでたっても役に立たないヤシチに、安純はもういいかげんうんざり。怒った安純は、ヤシチが大切に書きためていたメモを全て捨ててしまった。それに腹を立てたヤシチは、思わず家出をしてしまう。町をさまようヤシチは、その時一人の少女と出会い・・・？

本当はムルモのことが大好きなのに、気持ちを素直に伝えられず、つい冷たい態度を取ってしまうパピィ。そんなパピィのために、楓とリルムはみんなで一緒に水族館に行き、その途中でムルモとパピィを二人きりにしてあげようと計画するのだが・・・？

今日は妖精学校の遠足の日。大いにはしゃぐミルモたちだったが、ふとしたことから不思議な森の中に迷い込んでしまう。その森で出会ったのは、グルミ族という妖精たち。一同は帰り道を探すために、とりあえず彼らとともにグルミの村へ向かう・・・。

今度こそミルモの里を支配してやろうとお城に忍び込んだワルモ団は、マルモが大笑いしながらサリアの肖像画を破っている写真を発見する。その写真を見せられたミルモは大いにあせり、しかたなくワルモ団の言いなりになることに・・・。

ミルモとリルムの婚約記念日が近づき、幸せいっぱいな気持ちでお祝いの準備をするリルム。しかし記念日当日、ミルモが約束をすっぽかしてしまったからさあ大変。傷ついたリルムは実家に帰り、ミルモとの別れを決意する・・・。

今度の日曜日は、妖精学校チーム対抗運動会。楓はミルモ、リルムと三人一組のチームで参加することになる。だがその日は、楓の中学校の運動会が行われる日でもあった。しかもヤシチと安純の悪だくみにより、楓はクラス代表の選手に選ばれてしまい・・・？

自分専用のマグカップを手に入れた楓だったが、実は人間がそれを持つためには、毎週土曜日に妖精学校へ通わなければならないという厳しいおきてがあった。入学初日から、楓は教室で出会った超個性的な妖精たちや、ヘンテコな授業にとまどってしまう・・・。

ミルモを人質に取ったワルモ団は、マルモの城を乗っ取り国王になったことを宣言する。一方、楓はファンシーショップで、妖精界を自由に行き来できる魔法アイテム「マグカップ」を手に入れた。楓はミルモを助けるため、ミルモの里へ向かう！

今度こそミルモを倒そうと、作戦を練るワルモ団。まずはミルモのマラカスを奪い、魔法を封じることに成功した。マラカスを取り戻すため、ワルモ団のアジトに1人で乗り込んだミルモだったが、逆にワルモ団の罠にはまってしまい・・・？

マシュマロの食べすぎで、虫歯になってしまったムルモ。その虫歯を治療するために、ミルモは妖精界からデンタという歯医者を呼び出した。しかしムルモは治療を受けることをいやがり、ミルモたちから必死に逃げ続ける・・・。

今、リルムは妖精占いに夢中！練習した成果を見せようと楓たちの運勢を占ってあげるが、その超ハッピーな占い結果とは全く逆のことばかりが起こってしまう。落ち込んだリルムは、このままじゃ終われないと妖精カードに魔法をかけるのだが・・・？

ふと出会ったオトメという美しい妖精に、ヤシチは一目惚れしてしまう。しかも、勇気を出してアタックしてみたところ、何と付き合えることに！だが、絵の勉強をしたいという同居人とともに、オトメは突然パリへ行くことになってしまう・・・。

ムルモが突然行方不明になる。心配した一同は、ムルモを探して町外れの「お化け屋敷」と噂されるボロ家に足を踏み入れた。そこで起こる怪奇現象の数々に、ミルモたちは大いに恐怖する。さて、屋敷内でうごめく怪しい影の正体とは・・・？

ミルモの帽子の中がどうなっているのか、ふと気になった楓は、チョコでミルモの気を引いてつかまえようとする。しかし、そこで思わぬアクシデントが発生。なんと、チョコが入っていたビンの口にミルモの顔がすっぽりとはまり、抜けなくなってしまった！

楓の親友、悦美のおじいちゃんは「伝説の花火師」と呼ばれるゴンゾーさん。しかしゴンゾーさんは年のせいで花火作りに自信をなくし、突然花火師をやめると言い出した。ミルモたちは、悦美のために花火作りを手伝うことにするのだが・・・？