【シーズン1 最終話】おんぷは魔法使いであることがバレてしまったどれみたちのため、皆の記憶を消す魔法を使った代償に100年の眠りに落ちてしまいました。おんぷの眠りを覚ますためには、魔女になることをやめなければなりません。どれみたちが出した答えは…。

どれみたちの最後の魔女試験はいつもと違い、人間界の美空町で行われることになりました。魔法を使って良い事をして「ありがとう」と言われれば合格なのですが、それを島倉に目撃されてしまい、ウワサがウワサを呼びとんでもないことになってしまいます…。

電車の運転手をしているおんぷの父から、新型列車に招待してくれると、うれしい連絡が! 久しぶりにパパに会えるおんぷはとてもその日をたのしみにしていたのですが、その日はなんとオーディションの最終選考の日と重なってしまうのでした…。

おんぷファンの中田君はファンクラブに毎日メールを送っていると、おんぷからデートの誘いのメールが届きます。大喜びで待ち合わせ場所に向かうとそこには同じメールを受け取ったというファンが大勢。どうやら、おんぷの妖精ヘヘの書いたメールが原因のようで…!!

あいこのお父さんが会社の上司の薦めでお見合いをすることに!! 最初はお見合いすることをしぶるあいこでしたが、母は既に再婚していると思っていたので、承知してしまいます。しかしあいこの母は再婚しておらず、それを知ったあいこたちはお見合いを破談させようと…。

今回の魔女試験はなんとかくし芸!! マジョリカ達もすっかり芸の特訓にご執心の様子です。家族に宴会芸を教わるもイマイチ不安などれみたちは、マジックの得意なクラスメイトのみちあき君のマジックショーを手伝い、芸を学ぼうとするのでした。

年末も近いある日、どれみたちは街中で白い髭をたくわえたおじいさんに出会いました。実はそのおじいさんはサンタクロースだったのです!! そのサンタさんは体調が悪く大切なお仕事に支障が。それを見かねてどれみたちはそのお手伝いを申し出るのでした。

クラスメイトのむつみちゃんは大の女子プロレス好きで、キャンディ伊藤の大ファン。しかしせっかく観にいったキャンディ伊藤の試合は、アクシデントにより敗北。その後もキャンディ伊藤にアクシデントが重なるのを見て、どれみたちはバッドアイテムを探すことに…。

体の弱いしおりちゃんはなかなか自分を一人前に扱ってくれない父親に苛立ちを感じて、家出をしてしまいます。一方いつも高飛車な玉木も、おんぷの何気ない一言で一気に親への愛情に不安を感じてしまい、家を飛び出すのでした。家出した2人が偶然に出会ったことから…。

ヒーロー大好き少年、天野こうた君は特撮番組バトルレンジャーの大ファン。番組で姫役を演じたおんぷは、天野君を撮影現場に招待したのですが、それを知ったおんぷファンクラブ会長の橋本君は大激怒。天野君と決闘をすることになってしまいます。

クラスメイトの将太君は将棋がとても強いのに何故か嫌いだと言い張ります。それは将太君のお父さんがかつてプロ棋士を目指していたことと関係がありそう。将太君の本心に気付いたどれみたちは、将太君に将棋をさせてあげようと将太君のお父さんの説得に向かうのですが…。

魔女見習い3級試験は超難関。しかしデラ情報によると、試験に合格すれば、なんと魔法玉がたわわになる木の種がもらえるそうです。色々な障害をうまく切り抜けていくあいことはづきですが、一方どれみは…。

おんぷに魔法をかけられたクラスメート樋口まきの兄、秀三はなんとどれみに告白してしまいます。しかし魔法が解けた秀三はなぜそのようなことになってしまったのかさっぱりわかりません。仕方なくそのままどれみとデートに行くのですが…。

クラスメイトのりょうた君は大の怪獣好きで、家には怪獣ガザマドンの人形がびっしり。しかし怪獣作りに没頭しサッカーの試合をすっぽかしてしまったのを境に怪獣が嫌いになってしまいます。どれみたちは魔法を使ってなんとかしようとしますが、そこに現れたのは…。

大嵐に吹き飛ばされ人間界に迷い込んできた魔女ガエルたちは、せっかくだからと、どれみたちをお供に人間界の観光に出かけるのでした。人間界のさまざまな場所を満喫する魔女ガエルたちでしたが、最後に一つだけ行きたい場所があるのだと言います。その場所とは…。

どれみたちの四級試験の課題は勤勉なうさぎと素早い亀との障害物競走。走りの実力ではおジャ魔女たちはとうていかなわないので、魔法の使い方が勝利のカギとなります。ただしジャマしたり、ほうきで空を飛んだりすることは禁止。一体どう魔法を使えば良いのでしょう?

転校してきたおんぷちゃんは有名な芸能人。気立てが良く、おしとやかな彼女はすっかりクラスの人気者。そんなおんぷちゃんがとある映画のオーディションを受けることになり会場に行くと、そこにはなんと玉木の姿が! 何故かどれみもオーディションに参加し、波乱の予感が…!

大阪から来ていた母に再会しそびれたあいこは、母の手紙を父が見せずに隠していた事を知り、怒って家出してしまいます。どれみに離婚した原因が自分にもあるかも知れないと語るあいこ。翌朝、どれみ達3人は魔法のホウキで大阪へ。あいこは母と対面することができるのか?

今度の日曜は美空小の運動会。今回、最初で最後の6人兄弟が全員揃う運動会となる浜田いとこの一家は、とりわけ気合が入ります。どれみもリレーの選手に選ばれ猛特訓。そして運動会当日、奮闘する浜田兄弟にもアクシデントが続出、失敗ばかり。もしや…バッドカード?

2学期に入り、新たに学級委員を決めることになった1組。再選を目指す玉木に対して立候補したのは、クラスでも地味な存在の宮本まさはる。勉強、運動、何をやっても2番手の自分を変えたい…という彼を応援するどれみたちですが、真面目一筋のまさはるは分が悪いようで…。

花田志乃はモンゴル帰りの帰国子女。夏休みにモンゴルの少年･タミラから彼が大切にしていたぬいぐるみをお別れに貰い、お返しに何を贈ろうか悩んでいるのです。タミラの望みを知ろうとするのですが、相手が欲しい物を知るような高度な魔法は、6級魔女には不可能で…。

山内信秋くんはお寺の息子。夏休み恒例の肝試し大会で、お寺にクラスメイトたちが集まりました。怪談話の後、先陣を切って出て行った太田と杉山は、おじいさんの幽霊を目撃! 信秋くんに尋ねると、それは多分2年前に死んだ祖父で、心残りがあって成仏できないらしく…。

皆と夏祭りに来たどれみは、ゆき先生が見知らぬ男性と仲良く歩いているのを目撃! 関先生と一緒に尾行していると、男に後ろから突き飛ばされ、関先生のサイフとどれみの見習いタップが無くなっていました。これってスリの仕業!? 無事タップを取り戻せるのでしょうか?

はづきの別荘へ遊びに来たどれみは、テニスコートで出会った少年･柏木君に一目ぼれ。いつもの振られパターンと思いきや、星空を眺めながらいいムード。でも、彼の悩みは、好きな女の子に告白しようとすると必ずハプニングが起こって失敗すること。もしやバッドアイテム!?

どれみたちがピュアレーヌパソコンを動かしてみると、なんと画面に現れたのはハラマキ姿の変なオヤジ。このオヤジこそ、バッドカードを人間界にまき散らした張本人。罰としてパソコンに封印されているのです。彼が占うバッドアイテムの在処は、はづきの父の映画撮影現場!?

飯田かなえの家はステーキハウスだが、家族の入院、火傷に泥棒と最近は災難続きです。どれみは、彼女の店にある招き猫から怪しい気配を感じました。どうやら、かつて魔女界から盗まれたという不幸を呼ぶカード･『バッドカード』を宿したバッドアイテムのよう…。

やっとMAHO堂を取り戻したおジャ魔女たちですが、今度は魔法を使っている姿をぽっぷに目撃され、ぽっぷにも魔女見習いになってもらいます。魔法もほうきも商売も優秀なぽっぷですが、ある日、いじめっ子のきみたかを懲らしめようと、魔法で出したオバケが暴れ始めて…!

ララから「マジョルカの水晶玉がゴミに紛れて捨てられた」という情報をキャッチしたどれみたちは、早速ゴミ捨て場に駆けつけ、マジョルカより先に水晶玉をゲット! 水晶玉との交換条件にグッズの効果を消すことをマジョルカにつきつける3人ですが…。

魔法玉を全部使い果たしてしまったおジャ魔女たち。その上、父親とケンカしたあいこは家出して…。悩んでいた時、「どうしても必要なものなら、どんな苦労をしても手に入れろ」と矢田から言われて勇気付けられた3人は、魔法玉を手に入れる為、バイトを探しに魔女界へ!

デラから特別進級試験の情報を聞きつけたおジャ魔女たち。でも、MAHO堂の裏口を通らなければ魔女界には行けない! あの手この手でマジョルカをMAHO堂から誘い出そうとして全部失敗。美形店員の意外な正体をネタに、裏口を通らせてもらうことには成功するのですが…。