【シーズン1 最終話】転入生デュエマウスになりすました牛次郎は、勝太を倒すべく、るる、ハムカツ、ホカベン、ぶっちゃけを人質に残虐の限りを尽くすデュエマを仕掛けてきた! 絶体絶命に追い詰められた勝太。その時突如オデコが光り、デュエマウスの声が聞こえてきた…! 勝太に起死回生の一手はあるのか!? そして牛次郎の野望を阻止できるのか…!?

自らの身体を張ってデュエマーハカイツリーの野望を阻止したデュエマウス。バラバラになったデュエマウスの部品を手にした勝太は、デュエマウスを再び作るためロボットについて学び始めたのだった!! そんな中、ある日学校に突如デュエマウスが転入生としてやって来た。このデュエマウスは果たして本物なのか…!?

新幹部が敗北し、ついに1人っきりになってしまった牛次郎。一方デュエマウスは牛次郎と過ごした過去を思い出し、ある場所へ駆け出した…! 牛次郎を発見したデュエマウスはデュエマの楽しさを思い出してもらうため、直接対決を申し込む。復讐の権化となってしまった牛次郎にデュエマウスの思いは果たして伝わるのかっ?

デュエマーランド新幹部の1人、ゾンさんの力で街は映画さながらのゾンビタウンに変貌をとげてしまった。ゾンビを撃退しつつも次々と死亡フラグがたちまくる勝太達…。ぶっちゃけ･ホカベン･るるまでもゾンビになってしまった時、ついに勝太がゾンさんと直接対決へっ! と思いきや、勝太がとった行動は何だか違う!? 友を見捨てる主人公と友を大事にするゾンビ! それぞれの未来を勝ち取る闘いやいかに…!!

ギョウとの戦いでボロボロになった勝太をかばったのはデュエわんこ…!! と思いきや中身はやっぱりルシファーだった!! なんとルシファーはファンシーキャラを装いつつデュエマーランドを密かに調べていたのだっ! 完全復活した最強デュエリスト･ルシファーと最凶デュエリスト･ギョウがなつかしの舞台、デュエマ甲子園のフィールドでついに激突っ!! 再び時間は止まるのかっ…!!

デュエマーランド社長こと伝説の卑怯者･牛次郎。その真の目的は切札兄弟への復讐だった!! 世の中からデュエマを無くし切札兄弟が惨めな負け犬姿になることを夢見る牛次郎…。だがしかし!? そんな遠回りはやめて勝太たちを直接ぶっ潰すことを決意する! そんな牛次郎の行方を捜す勝太達のもとに突如ギョウが姿を現した!! ギョウは牛次郎のスパイだったことをあっさり告白。しかしそれには牛次郎に従うしかなかった深い理由が…!?

時はまさにバレンタインデーっ!! 勝太にどうにかいい感じにチョコを渡したいるるは、ひとり脳内会議を開始するっ! ヒロインとしてのパワー、ヒロイン力の低下問題を解決術く、るるは「ヒロイン道場」の扉をたたく。アイドルから魔法少女まで、幾多のヒロインを生み出してきたといわれるヒロイン道場の実態とは…。っ!? 乙女の想いが大暴走っ!! 勝太にコジロー、さらには熱血ナレ太郎までをも巻き込んで、町内大騒ぎっ!! 激しかりしデュエマの果てに、るるのチョコの行方や如何にっ!?

デュエ悪マ城に隠されたドキンダムXのカードを取り戻し、デュエマーランド社長の元へたどり着いたバサラ! ハカセとランボーの仇、そして自分のデュエマを邪魔した復讐をすべく社長にデュエマを申し込む! 山札やシールドにカードを仕込み、イカサマでデュエマを有利に進める社長っ! それに構わず叩き潰さんとするバサラっ! 勝太たちが社長とバサラの元へたどり着こうというその瞬間、デュエ悪マ城に大異変が起きるっ!? デュエマーランド社長の野望が遂に動き出すっ! そしてドキンダムXを使うものに宿命づけられた運命とは一体っ!?

ハカセたちがゾンさんと戦っているスキに、次のアトラクションへとたどり着いた勝太たち! 扉を開けると広がっていたのは…。大宇宙っ!? かと思いきや、手作り感満載のショボい部屋だった。勝太たちがガッカリしたり呆れたりしていると、異様な迫力の黒服2人組が現れて…。っ!? 大ピンチな勝太たちを救うため、デュエわんこが駆けつけるっ!! どうみても宇宙人な新幹部･チューやん登場っ!! ヤンキー全開なチューやんの無重力デュエマに立ち向かうは、謎のファンシーキャラ･デュエわんこっ!! 謎が謎呼ぶ大決戦開幕っ!!

デュエマーランド社長への復讐を胸に誓い、デュエ悪マ城に潜入したバサラ、ハカセ、ランボー! 最上階へと向かう途中、ハカセとランボーをゾンビ化させた新幹部の一人･ゾンさんの居場所を突き止める。ハカセとランボーはバサラを先に行かせ、ゾンさんへのリベンジを果たそうとアトラクションへ突入するっ! 死亡フラグを立てまくるハカセとランボーっ! ゾンビ化されたかつての部下たちをかきわけて、ついにゾンさんとのリベンジマッチっ! 2人同時に相手してやると豪語するゾンさんの実力とはっ!? ゾンビだらけのデュエマが始まるっ!!

仲間となったデュエマウスと共に打倒デュエマーランドに立ち上がった勝太たちっ! しかしデュエマーランドのアトラクションのひとつ「デュエマ城」は悪魔の城へと変貌していた! その名も「デュエ悪マ城」!! 城内で待ち受ける新デュエマーランド幹部を倒し、社長の元へとたどり着くことができるのかっ!? 新幹部･ゲンちゃん登場っ! 原始人ながら礼儀正しいエリートビジネスマンなゲンちゃんだが、とある数字をきっかけにヤバい本性が明らかにっ!?そして侵略の上をいく新能力「S級侵略」とはっ!?1･2･3でデュエマスタートっ!!

デュエマウスは爆破され、バサラたちデュエマーランド幹部はリストラっ!! ギョウと共に怪しげな動きをするデュエマーランド社長は、「デュエマーランド大反省会」の開幕を宣言するっ!! 大ホールに集められたデュエマーランド社員たち。ステージに現れた社長は、気に入らない社員をクビにしまくりつつ、デュエマーランド幹部がリストラされた理由を語りだす…っ! ワンマン経営ここに極まれりっ!! 明かされるデュエマーランド社長の企みの全貌、そして新たなデュエマーランド幹部が着任っ!? 一体どうなるデュエマーランドっ!?

デュエマーランドからの使命を受け、勝太をデュエマで追い詰めるデュエマウスっ! あと一歩でデュエマウスの勝利…というところで、デュエマウスの記憶に異変が起きるっ!? デュエマーランド社長によって、記憶を操られていたデュエマウスっ! 勝太たちはデュエマウスとのこれまでの日々を思い出させようとするが…っ!? ついに明らかになる、デュエマウスの中の人･忠次郎の本当の正体っ!? そしてデュエマーランド社長が選んだ最悪の選択肢とは…っ!? デュエマーランドに嵐が吹き荒れるっ!!

勝太とバサラのデュエマはますますヒートアップっ! ボルシャック･ドギラゴンとドキンダムXが激突しようとしたその時バサラを青い業火が襲うっ! 禁断のカードがついにバサラを蝕もうとしたのを察知しデュエマーランド社長はついに奥の手を発動し…っ!? 一方、デュエマーランドは「デュエルマ･スターカップ」終了のお知らせで大パニックっ! 戸惑う勝太の前に現れたのはデュエマウスっ!? ついに明らかになるデュエマーランドの企みっ! 社長とデュエマウスの恐ろしい本性が露わになるっ!? デュエルマ･スターカップ最終戦開幕っ!!

ボルシャック･ドギラゴンを手に入れ、月から戻ってきた勝太たち。旅の疲れを癒すため立ち寄ったカードショップ滝川で勝太たちを待ち受けていたのは、新たなファンシーキャラだったっ! 紳士な態度に優雅な振る舞い、顔はわんこのデュエわんこっ!? 謎多きファンシーキャラ･デュエわんこは、どうやらバサラと深からぬ因縁があるようで、勝太をバサラと引き合わせる。新たな革命の力を手に入れた勝太は、バサラの禁断カードにリベンジを果たすことができるのかっ!? 激闘デュエマは新たなステージへっ!!

月面での兄弟対決っ!! 新カードを手に入れ調子付く勝太に対し、勝舞は語り継がれる伝説の名「ボルシャック」を持つドラゴンで迎え撃つ! 激しいデュエマが続く一方で、何故か月のバリアに穴が空き、空気がどんどん抜けていく事件が発生っ!! 月の影響でかしこくなったハムカツとベンちゃんは、原因究明に奔走するが…っ!? 宇宙規模の兄弟バトル、ついに決着っ!! 2体の「ボルシャック」が激突する激アツデュエマの行方はっ!? そして勝太たちは、無事に月から脱出できるのかっ!? 勝太は生き延びることができるかっ!?

宇宙人･カツカレーの手助けもあり月へと旅立った勝太たち! しかしカレーパン欲に耐え切れず、勝太はカレーパン型UFOを食べ始めるっ! 墜落しつつもなんとかたどり着いた勝太たちだったが、堕ちた先にはなんとジャングルがっ!? 巨大動物に宇宙人がひしめく月の王国を治めていたのはやはりあのアニキだったっ! ついに月面の王者となった兄と再会した勝太っ! 新たなる革命カード「ボルシャック･ドギラゴン」を受け取った勝太だが、それと引き換えに勝舞が要求したものとは…っ!? スケールデカすぎ兄弟喧嘩、ついに宇宙で再始動っ!!

バサラに敗北し、腕もペッキリ折れてしまった勝太。塞ぎこんでいた勝太だったが、ふと夜空を見上げて驚愕っ! なんと月面に勝太の顔が描かれていたのだっ! こんなことができるのは一人しかいない! 伝説の最強デュエリストにして勝太の兄、切札勝舞っ! 勝太の元に届いた勝舞の手紙っ! 「月面で待つ」という兄の声に応えるべく月へ行く方法を模索する勝太。そこに現れたのは、かつて勝太が助けた宇宙人･カツカレーだったっ! 勝利のための熱い気持ちとカレーパンへの食欲がせめぎあうっ!! 果たして勝太たちは宇宙へ旅立てるのかっ!?

ルシファーからの連絡がないことを不審に思う勝太とるる。突如現れたデュエマーランドの社長はルシファーがバサラとの死闘の末死んだことを勝太に告げるっ! 真相を確かめられぬまま、勝太はバサラをぶっ倒すべく、ジェットコースターの頂上へ! 待ち構えるバサラの心中は如何にっ!? ついに激突、勝太VSバサラっ! そして明かされる「禁断」のレジェンドの恐るべき能力っ! 果たして勝太とドギラゴンは革命の力で禁断のカードを食い止めることができるのか!? そしてルシファーの仇をとることはできるのかっ!? 激闘が始まるっ!!

デュエマーランドへ行ったまま、連絡がつかないルシファー。勝太たちはルシファーの行方をつかむべく、デュエマウスから情報を聞き出そうとするっ! しかし、デュエマーランド内にはデュエマウスが大量発生っ!? 本物のデュエマウスの中の人･忠次郎を探すべく、奔走する勝太とるるだったが…っ!? ついにデュエマウスを追い詰めたるる! 一方、勝太はデュエマーランド幹部の一人･ランボーと対決することにっ!? 同時多発のダブルデュエマを見逃すなっ!!

一昔前の人気アニメ「超時空戦士ダンボールフォーマーZ」のハリウッド映画化が决定っ! そしてその主役に選ばれたのは、なななんと飢えた野獣･コジローっ!? ハリウッドからの高額オファーを前に、デュエマのことなどすっかり忘れハリウッドスターを目指さんとするコジロー。騙されているんじゃないかと不安がる弟たちをさておいて、本当にハリウッドまで来てみたが…っ!? おかしな撮影現場! 叫ぶコジロ－! うさんくさい映画監督! そして突如現れたハカセっ! 全てが交差するデュエマinハリウッド、レッツスタートっ!!

禁断のレジェンドカードの力が開放された時、その強大な力でデュエマが崩壊するっ!? 禁断のカードを再び封印すべく、デュエマーランドに忍び込むルシファー。待ち構えていたバサラは、ルシファーにリベンジを果たすべく闘志を燃やしていたっ!! デュエマーランド社長の企みにより、ルシファーは己の命をかけてデュエマに挑むっ!! 禁断のレジェンドカードは、時を止めるルシファーのデュエマでさえも打ち破るのかっ!? 最速改め、最凶VS最強っ!! 勝つのはどっちだっ!!

時はハロウィンっ! デュエマーランドでもハロウィンイベントが開催され、誰もが仮装で大盛り上がり。しかし、ハロウィンを阻止しようとする男が一人…。そう、ぶっちゃけだっ!「チャロウィン革命軍」としてデュエマーランドに乱入したぶっちゃけ。ただのモテない男のやっかみかと思いきや、ぶっちゃけには意外な協力者がっ!? ハロウィンイベントを続行するため立ちはだかるデュエにゃんこの前に、熱い魂を持ったあの男がリングインっ! ハロウィンVSチャロウィン、結果は如何にっ!?

禁断のカードを手に入れたバサラっ! カードの謎の文字は一切読めないものの、カードの発する光に導かれバサラが訪れたのは、極寒の地･南極! 謎の遺跡を探るバサラの前に現れたのは、かつてデュエリストを抹殺し、世界を我が物にせんとしたあの男…!? 禁断のレジェンドカードの持つ最強の力を巡って、最速の男･バサラとかつて神をも従えた男が激突っ! 禁断のレジェンドカードの力を手に入れるのは果たしてどちらなのかっ!? 野望渦巻くデュエマが始まるっ!!

デュエマーランドのファンシーキャラランキング1位を独占してきたデュエマウス。しかし、その座を脅かす新しかりしキャラが突如現れたっ! その名もデュエにゃんこっ!! 着ぐるみを超越したリアルすぎる猫の演技でデュエマーランド中の人気をかっさらったデュエにゃんこ。ショックを受けたデュエマウスはこっそりと家出を決意する。その道中で出会ったのはコジローの弟、中ジローっ!? 仁義なきファンシーキャラ戦争っ! 失意のデュエマウスは果たしてデュエマーランドに帰ってくるのかっ!? 愛と哀しみのファンシーデュエマ、開幕っ!!

アニメ「何度も再生日本の昔ばなし」に夢中の勝太。つい気づかず、デュエマーランド社長自慢のアンテナを物かけ代わりに使ってしまう。痛く傷つくデュエマーランド社長を見たデュエマウスは、勝太への制裁を誓うっ!! 「中の人などいない」はずのデュエマウスの中身がついに判明っ!? そして明らかになるデュエマウスとデュエマーランド社長の過去っ! 本気のデュエマを見せるデュエマウスに、勝太は如何に立ち向かうのかっ!? 着ぐるみ業界騒然の衝撃デュエマを見逃すなっ!

飢えた野獣･コジローが、なんとデュエマ引退宣言っ!? その理由は、3人の弟たちにあった。腹をすかせた弟たちを救うために、デュエマのカードを全て売り払おうとしたのだったっ! 必死でコジローを止める弟たち。そんな折、謎の手紙がコジローの元に届く…! 昨年のデュエマ甲子園決勝戦の雪辱を晴らすべく、飢えに飢えまくった本気のコジローが勝太の前に立ちはだかるっ! 果たして勝太とドギラゴンは、飢えた野獣の猛攻を凌ぎきることができるのかっ!? 男のプライドをかけたデュエマが始まるっ!

野球キャラといいつつまったく野球をやっていなかったホカベンだったが、V中野球部は決勝にコマを進めていた! デュエマそっちのけで練習するホカベン! 強敵を打ち破るため野球場でナイター練習させてほしいと土瓶先生に交渉する。一方、ストライキが起き電力が停止してしまったデュエマーランド。大量の電気を必要とするデュエマーランド社長は、電気を求めて八尾町を飛び回るっ! デュエマーランド社長がついに姿をあらわすっ! その正体とは、そしてデュエマの実力とはっ!? ホカベンのバットが唸るスポ根デュエマ、プレイボールっ!!

デュエマーランド社長の介入により、大切なものをかけて闘うとこになったルシファーとバサラっ! 圧倒的なスピードで攻めまくるバサラ。一方のルシファーは病気の完治と引き換えにカードの声が聴こえなくなっていたっ!! しかし、ルシファーには新たなる「時を止める」デュエマを完成させたというが…っ!? 最強VS最速、ついに決着っ!! そして明かされる、革命と侵略を超えた、封印されし禁断のカードの存在…。デュエマーランド激震の新展開、スタートっ!!

デュエマーランドの社長と3幹部は、何者かがデュエマーランドの秘密を探っていることに気づく。ネットワーク上に残された薔薇のマーク…。そう、ルシファーはデュエマーランドを調査しつつ、バサラたちに宣戦布告していたのだったっ! ついに明らかになるバサラの過去。果たしてバサラがスピードを追い求める理由は何なのかっ!? そしてついにルシファーとバサラがデュエマで激突っ!! 圧倒的なバサラの速攻に、ルシファーはどう立ち向かうのかっ!? 最強VS最速、開戦っ!!