予防注射に行く日、注射嫌いのはなかっぱは朝からドンヨリ。そんなとき、同じく注射嫌いのおじいちゃんは仮病を使って、逃れようとするが、失敗してしまう。いよいよとおじいちゃんははなかっぱを連れて、家から逃げ出してみたのだが。

女の子だけでカレーパーティーをすることになったももかっぱちゃん･みろりん･ベーヤちゃん。なんとか料理下手なももかっぱちゃんに作業をさせないようにする二人だったが、カレーの味がなかなかうまくまとまらない。そんなことをしているうちにももかっぱちゃんの手がカレー鍋に伸びて。

ある日、息をのむほど美しい宝を探しに、洞窟へ探検に出かけた男の子たち。そこにがりぞーとアゲルちゃんがわか蘭を咲かせようと探検隊に変装してやってくる。果たして、はなかっぱたちは、無事宝を発見することができるのだろうか!?

調理実習でショートケーキを作ることになったみんな。それぞれ材料を持ち寄ることになったのだが、はなかっぱはいざとなれば自分でイチゴを咲かせれば良いと、どんどん後回しに。ところが、調理実習当日、どんなに頑張ってもイチゴが咲かないはなかっぱは……

とりあえずの花がしおれてしまい、何か咲かそうとしても何の花も咲かないはなかっぱ。花の病気かもしれないと思ったおじいちゃんからそのことを聞いたがりぞーとアゲルちゃんは、「これでは『わか蘭』が咲かなくなる」と、お医者さんであるベーヤちゃんのお父さんを探しに行く。

ごはんを食べているはなかっぱの頭に突然なんじゃもんじゃの木が! そのせいで何でも質問をしたくなったはなかっぱは家族全員に次から次へと質問を浴びせる。そのうえ、いつも通り『わか蘭』を咲かせようとやってきたがりぞーとアゲルちゃんまでも質問攻めにして。

はなかっぱたちが遊んでいるところへ小さい妹のピーヨンを仕方なく連れてきたコケヤン。いつも通りみんなと遊ぼうとするが、ピーヨンがうまく馴染めないので、おいていくことに。とは言え気になって仕方ないコケヤンはしばらくしてピーヨンの元に向かうのだが、そこにピーヨンの姿はなくて。

はなかっぱの頭に何かの花が咲いた。いつも通りつねなりに花の名前を聞くと、つねなりは図鑑をなくしたことに気付いて、二人で探すことに。落ち着きを失ったつねなりの前に図鑑に変装したがりぞーがあらわれるのだが。

ある日、おじいちゃんが偶然はなかっぱのアルバムを見つけ、家族みんなで見ることに。幼い頃のはなかっぱを思い出しながら、その成長にあらためて感動し、はなかっぱのこれからに期待するみんな。そんな中はなかっぱが学校からいつも通り帰ってくる。

はなかっぱは、冒険で『光る花』や『走る花』、『踊る花』などたくさんの花と出会ってゆく。山の頂上にぽつんと咲く花や、砂漠のまんなかで力強く咲くサボテンの花に感動する、はなかっぱ。そして砂漠でみつけたオアシスで、はなかっぱたちの前に花の怪獣があらわれる。

はす次郎じいちゃんに「どうして自分の花をハスの花にしようと思ったの?」と聞いた、はなかっぱは、おじいちゃんと一緒に大冒険の旅にでる。はす次郎じいちゃんは昔自分の花を決めるときに、世界中の花を見てから決めようと思ったのだ。

きょうは朝からももかっぱちゃんのようすがおかしい。「なにか悩みごとでもあるのかな?」と心配になったはなかっぱが聞くと、ももかっぱちゃんは「実は…ひっ…ひっ…ひっこ…」と言いかける。「ももかっぱちゃんがひっこし!」と思ったはなかっぱは、みんなとお別れパーティーをひらくことにする。

今夜はやまびこ村のお祭りで、ダンスコンテストも開かれることに。ダンスの踊れないはなかっぱたちは、ダンスを教えてもらって練習しようと思いついて、ももかっぱちゃんのお兄さんに会いに行くのだった。

魔法使いごっこをしてあそんでいる、はなかっぱたち。そこに魔法使いに変装したがりぞーとアゲルちゃんがあらわれる。がりぞーたちははなかっぱに、「わか蘭をさかせてくれたら空を飛べる魔法のホウキをかしてあげる」とうそをつく。

自分たちで「やまびこ音楽団」をつくって演奏しようと、楽器をつくっているはなかっぱたち。楽器をつくる材料をさがしにはなかっぱの家をさがしていると、なんとバイオリンが見つかった! なかなかうまくバイオリンの弾けないはなかっぱが、もう練習するのをあきらめようとすると…

はなかっぱとももかっぱちゃんがドングリひろいをしていると、田中先生がやってくる。田中先生が夕日がとてもキレイに見られるとっておきの場所に行くと聞いたはなかっぱたちは、先生に連れられていっしょに夕日をみにいくことになる。

お医者さんのお父さんと、看護師さんのお母さんのお手伝いをする、ベーヤちゃん。はす次郎に「立派な看護師さんになれる」とほめられたベーヤちゃんは、うれしくなってはなかっぱたちがちょっと怪我するたびにお手当しようと夢中になる。

蝶兵衛のおやしきにあったアルバム写真にのっていた、『金色のバラ』。蝶兵衛がこどものころに見つけた、キラキラとまぶしいくらい金色にかがやく美しい花なのだ。それを聞いたアゲルちゃんは、蝶兵衛にもう一度『金色のバラ』を見せてあげようと、一人でさがしにいくことにする。

蝶兵衛がおやしきで、自分のお宝コレクションをがりぞーとアゲルちゃんに自慢している。いつも同じものを見せられて退屈しているがりぞーとアゲルちゃんだけど、今日はとっておきのスゴイお宝を見せてくれるという。

きょうは、やまびこ村の運動会。はなかっぱたちは赤組と白組にわかれて、玉入れやつな引き、かけっこで対決することに。そこに、どさくさにまぎれて『わか蘭』をうばおうと、がりぞーも変装してやってくる。

学校からすぎる君と二人で帰る、はなかっぱ。すぎる君は青空や白い雲、飛んでいくちょうちょをみるたびに、なんにでも感激しちゃう。とそこに、がりぞーとアゲルちゃんが、すぎる君のご先祖さまに変装してあらわれるのだった。

やまのふじと、やまのふじのお父さんが橋の修理をしているところに通りかかった、はなかっぱたちは、みんなでお手伝いをすることに。はなかっぱをピンチにさせて『わか蘭』を咲かせようとするがりぞーは、橋の両端をかじってしまう。

はなかっぱとももかっぱちゃんは、二人で「お花屋さん」をひらくことにする。なかなか注文通りに花を咲かせることのできないはなかっぱだけど、お客さんが喜んでくれるのをみてうれしい。そこにがりぞーとアゲルちゃんが変装してやってきて、『わか蘭』を咲かせてくれとたのまれるのだけど…

山の上にスケート場をつくって、はなかっぱたちをつれてきた、がりぞーとアゲルちゃん。はなかっぱをツルンとすべらせて『わか蘭』を咲かせようとたくらんでいるのだ。スケートの先生に変装したがりぞーは、はなかっぱの手を引いてスピードアップしてすべってゆく。

はなかっぱが家でオヤツが食べたいとダダをこねていると、頭にアリウムという花が咲いた。「涙草」ともよばれるこの花が咲いて、はなかっぱが泣き虫になってしまった! 友達同士がケンカしていても泣きながら止めようとするはなかっぱだったけど…

しまってあった宝箱をみつけた、つねなり。宝箱の中からビー玉やコマといっしょに出てきたのは、線香花火だった。つねなりのおばあちゃんが元気なころ一緒にやった、思い出の花火だという。はなかっぱたちは線香花火を天国のおばあちゃんに見せてあげようと夜に集まるのだけど…

教科書をなかなか早くよめなくて落ちこんでいる、ベーヤちゃん。なぐさめるはなかっぱたちのまえに、「早口ことば名人」に変装したがりぞーとアゲルちゃんが現れる。二人は『わか蘭』を咲かせてくれたら早口ことばのコツを教えるとうそをつく。

おなかがすいた友達たちに食べさせてあげようと、頭にバナナを咲かせた、はなかっぱ。ところが大成功すぎて、たっくさんのバナナがさいてしまった。友達やお父さんたちに食べさせても、まだまだバナナが残ってしまって、はなかっぱはこまってしまう。

てんぐ池におじいちゃんと遊びにきた、はなかっぱたち。頭に咲いた葦で、おじいちゃんに舟をつくってもらった皆は舟をこいで進んでいく。そこにあらわれたがりぞーとアゲルちゃんは、はなかっぱをおどろかせて『わか蘭』を咲かせようと、舟が進むのをじゃましようとする。

はなかっぱを悩ませると『わか蘭』を咲かせるのではないか、と考えたがりぞーとアゲルちゃん。佐藤先生と田中先生に変装した二人は、居残り授業をさせたり、なぞなぞを出したりして、はなかっぱを悩ませようとする。