フランケンロボくんと出会った、けむりいぬ。フランケンロボくんのパパを、一緒に探してあげることにするんだ。何にでも変身できるけむりいぬは、ライオンに変身! フランケンロボくんを背中に乗せて、パパを探しに出発だ!

旅のお空のおむすびまん。ばいきんまんにおそわれていた、あめふりアメちゃんを助けてあげるよ。アメちゃんは、たわらくんの田んぼに、雨をふらせに行くところだったんだ。それを聞いたおむすびまんは、アメちゃんのおともをすることに。

町で美味しいとんかつを作る、とんかつぼうや。とんかつが食べたいばいきんまんは、とんかつぼうやを連れて行ってしまうんだ。ばいきんまんに言われても、なかなかとんかつを作らない、勝ち気なとんかつぼうや。ばいきんまんに、勝負しようと言い出して……?

ちびおおかみにイジワルをするばいきんまんを、カッコよく追い払う、かつぶしまん。だけど、ちびおおかみをネコとカン違い! 怖くて逃げてしまうんだ。まだまだ未熟 (みじゅく) だと感じたかつぶしまんは、ちびおおかみと、修行に出かけるよ。

トランプの国からやって来た、フラッシュとストレート。ばいきんまんにおそわれていたところを、コキンちゃんに助けてもらうんだ。フラッシュとストレートの不思議な魔法を見たコキンちゃんは、自分も魔法が使いたいと言い出して……?

クッキーを配達するクリームパンダ。道に迷っていたところで、ショウガナイさんと出会って、道を教えてもらうんだ。ところが、ばいきんまんにおそわれて、クッキーの入ったカゴをなくしちゃった……。困っているクリームパンダに、ショウガナイさんは……。

うどんくんと出会った、しょくぱんまん。うどんくんが作る、真っ白なうどんに感動するよ! その様子を見ていたドキンちゃんは、美味しいうどんを作るために、うどんくんに作り方を教えてもらうんだ。がんばれ、ドキンちゃん!

メロンパンナは、ロールパンナの悪い心が消えるかもしれない! と思って、まごころ草を探しに行くよ。だけど、ばいきんまんがバイキン草エキスを使って悪い心を強くして、ブラックロールパンナになってしまうんだ!

おいしいお野菜を配ってくれるおくらちゃん。お野菜を渡す時に、うるうる泣いてしまうんだ。その様子を見た大根役者は、おくらちゃんを、でんでん一座の新しいお芝居の主役にするよ。一体どんなお芝居になるのかな?

可愛いキャンドルを作ってくれるキャンドルちゃん。ビクビクちゃんもメロンパンナと一緒にキャンドル作りをする約束をするよ。だけど、ばいきんまんがキャンドルちゃんを捕まえてしまうんだ。ビクビクちゃんは、助けだせるかな?!

旅の途中、砂漠にたどり着いたタオルくん。でも、のどがかわいてもうヘトヘト。そこに、ナンドバットがやって来て、聖なるオルゴールで雨を降らせてくれるよ。元気になったタオルくんは、ナンドバットに砂漠の町へ連れて行ってもらうんだ。

くらがりの森にやって来たなまいきナマコが、ビクビクちゃんに出会って、仲良くなるよ。二人は、ジャムおじさん達と一緒に、アンパンマン号に乗って海へ遊びに行くよ! バーベキューをしたり、海で泳いで遊ぶんだ。

泣いているあかちゃんまんを見つけたカモメくん。カモメくんのタマゴのカラを気に入ったあかちゃんまんは、カラに入ったまま外へ遊びに行っちゃうんだ。カモメくんは、勇気を出して追いかけていくよ!

雨宿りしたニガウリマン。ビクビクちゃんに驚いて、逃げちゃうんだ。だけど、ビクビクちゃんがお化けなのにこわがりだと知って、一緒にギターを弾いて歌ったり、色んな所へ行って仲良くなるんだよ。

いつも元気いっぱいのコネギくん。とってもかっこいいナガネギマンに出会って、弟子にしてもらおうと張り切るよ! ばいきんまんは、ナガネギマンのふりをして、コネギくんにイタズラしようと考えるんだ。