冒険家・マツゲール博士と共に旅を続けていたキョロちゃんだったが、旅の途中で嵐に遭い、離ればなれになってしまう。再び生まれ故郷のエンゼルアイランドに戻ったキョロちゃんは、そこでパチクリ君と出会い、友だちになる。その日から、キョロちゃんのエンゼルアイランドでの生活と冒険が始まるのだった。