【シーズン3 最終話】10本のビンは無事に回収され、ジャックは残された1本のビンを運ぶ男を追い、ロサンゼルスの地下鉄へ。一方、ウェインはパーマーにシェリーの身に何が起きたかを告げる。そしてトニーは、ジェーンの身柄をサウンダースに引き渡そうとしたことで責任を取らされる。

【シーズン3 最終話】10本のビンは無事に回収され、ジャックは残された1本のビンを運ぶ男を追い、ロサンゼルスの地下鉄へ。一方、ウェインはパーマーにシェリーの身に何が起きたかを告げる。そしてトニーは、ジェーンの身柄をサウンダースに引き渡そうとしたことで責任を取らされる。

ジャックはついにサンダースを逮捕し、サウンダースはウィルスの11個のビンの内、10個の場所を明らかにする。ジャックは最後の1本を回収するためLAの地下鉄に乗り込む。そんな中、ウェインとフォクストンがシェリーの家に侵入し、ミリケン殺害の証拠を掴む。

ジャックはついにサンダースを逮捕し、サウンダースはウィルスの11個のビンの内、10個の場所を明らかにする。ジャックは最後の1本を回収するためLAの地下鉄に乗り込む。そんな中、ウェインとフォクストンがシェリーの家に侵入し、ミリケン殺害の証拠を掴む。

CTUでは、トニーがジェーンを連れ出したことが発覚。ジャックはジェーンを引き渡そうとするトニーを尾行するが、ミシェルは自力でサウンダースの元から脱出する。一方、パーマーの対抗馬、キーラー上院議員は、ミリケンの死をパーマーが握りつぶしたことを知る。

CTUでは、トニーがジェーンを連れ出したことが発覚。ジャックはジェーンを引き渡そうとするトニーを尾行するが、ミシェルは自力でサウンダースの元から脱出する。一方、パーマーの対抗馬、キーラー上院議員は、ミリケンの死をパーマーが握りつぶしたことを知る。

ジャックとチェイスのチームは、サンダースの隠れ家を急襲するが、もぬけの殻だった。そこでジャックは、サウンダースの逃走経路を探る。一方、トニーは密かに、ジェーンとサンダースに捕まっているミシェルの身柄の引き渡しを計画する。そんな中、シェリーはパーマーの対抗馬に取引を持ちかける。

ジャックとチェイスのチームは、サンダースの隠れ家を急襲するが、もぬけの殻だった。そこでジャックは、サウンダースの逃走経路を探る。一方、トニーは密かに、ジェーンとサンダースに捕まっているミシェルの身柄の引き渡しを計画する。そんな中、シェリーはパーマーの対抗馬に取引を持ちかける。

パーマーは、サンダースの要求に頭を悩ませていた。CTUは、サウンダースの居所を知るためジェーンを捉えたが、娘を拉致していることがバレてしまい、サウンダースは隠れ家から行方をくらます。一方、ミシェルはウィルス感染を免れたが、CTUのスタッフ、アダムの妹が感染してしまう。

パーマーは、サンダースの要求に頭を悩ませていた。CTUは、サウンダースの居所を知るためジェーンを捉えたが、娘を拉致していることがバレてしまい、サウンダースは隠れ家から行方をくらます。一方、ミシェルはウィルス感染を免れたが、CTUのスタッフ、アダムの妹が感染してしまう。

サンタバーバラの大学に通うサウンダースの娘ジェーンを取り押さえるため、年恰好の似たキムが変装して身代わりになる。 CTUは、ホテルから姿を消した男の後を追う。そんな中、パーマーは、サウンダースからさらなる要求を突きつけられる。

サンタバーバラの大学に通うサウンダースの娘ジェーンを取り押さえるため、年恰好の似たキムが変装して身代わりになる。 CTUは、ホテルから姿を消した男の後を追う。そんな中、パーマーは、サウンダースからさらなる要求を突きつけられる。

サウンダースの要求は、ＣＴＵ本部長シャペルの死だった。ジャックは要望どおりシャペルを殺そうとする。チェイスは、サウンダースのアパートの捜索に向かう。そんな中、ミシェルは、ウィルスに感染した男がホテルから消えたことを知らされる。

サウンダースの要求は、CTU本部長シャペルの死だった。ジャックは要望どおりシャペルを殺そうとする。チェイスは、サウンダースのアパートの捜索に向かう。そんな中、ミシェルは、ウィルスに感染した男がホテルから消えたことを知らされる。

ジャックはウィルステロの黒幕はかつての同僚、サウンダースだったと気付く。サウンダースは要求を呑まなければさらなるウィルスをばらまくとパーマーに伝える。ミシェルとトニーはホテルの人々がウィルスに感染したことを知らされる。

ジャックはウィルステロの黒幕はかつての同僚、サウンダースだったと気付く。サウンダースは要求を呑まなければさらなるウィルスをばらまくとパーマーに伝える。ミシェルとトニーはホテルの人々がウィルスに感染したことを知らされる。

ジャックはわざとアマドールを逃がし、彼を追跡する。ミシェルとガエルが捜索しているホテルでは、ウィルス拡散の恐怖でパニックになる。一方、シェリーは、あくまでも無実を主張する。パーマーはことの真偽はどうであれ、彼女を守ると約束する。

ジャックはわざとアマドールを逃がし、彼を追跡する。ミシェルとガエルが捜索しているホテルでは、ウィルス拡散の恐怖でパニックになる。一方、シェリーは、あくまでも無実を主張する。パーマーはことの真偽はどうであれ、彼女を守ると約束する。

ジャックはついにアマドールを捉えるが、ウィルスは既に持ち去られていた。ウィルスを手にしたアルバースは、チャンドラー･プラザ･ホテルにばらまく手はずを整える。一方、警察はミリケンが死んだとき、シェリーがその場にいたことを突き止める。

ジャックはついにアマドールを捉えるが、ウィルスは既に持ち去られていた。ウィルスを手にしたアルバースは、チャンドラー･プラザ･ホテルにばらまく手はずを整える。一方、警察はミリケンが死んだとき、シェリーがその場にいたことを突き止める。

ニーナとともにＬＡに到着したジャック。トニーはニーナの尋問を始める。一方、ジャックは麻薬問題について尋問を受けることに。そんな中、クロエが連れてきた赤ん坊がチェイスの子だと知ったキムは、戻ってきたチェイスに詰め寄る。一方、シェリーは、ミルケンの突然の死は自分の責任ではないと言い張る。

ニーナとともにLAに到着したジャック。トニーはニーナの尋問を始める。一方、ジャックは麻薬問題について尋問を受けることに。そんな中、クロエが連れてきた赤ん坊がチェイスの子だと知ったキムは、戻ってきたチェイスに詰め寄る。一方、シェリーは、ミルケンの突然の死は自分の責任ではないと言い張る。

ジャックは捜査を手伝うというニーナをＬＡに連行する。 しかし、ＣＴＵでは、ニーナがセットしていたコンピューター･ウィルスが起動し、大混乱に陥る。一方、ミリケン邸でシェリーはジュリアに詰め寄り、夫が男の拉致にかかわった証拠を探すよう要求する。

ジャックは捜査を手伝うというニーナをLAに連行する。 しかし、CTUでは、ニーナがセットしていたコンピューター･ウィルスが起動し、大混乱に陥る。一方、ミリケン邸でシェリーはジュリアに詰め寄り、夫が男の拉致にかかわった証拠を探すよう要求する。

ニーナが、アマドールからウィルスを受け取った瞬間、CTUが現場に突入しようとするが…。一方、シェリーはミルケンの弱みを握り、逆に脅そうとするが失敗する。その頃CTUでは、ベビーシッターが面倒を見れずに連れて来たクロエの赤ん坊がいた。

ニーナが、アマドールからウィルスを受け取った瞬間、CTUが現場に突入しようとするが…。一方、シェリーはミルケンの弱みを握り、逆に脅そうとするが失敗する。その頃CTUでは、ベビーシッターが面倒を見れずに連れて来たクロエの赤ん坊がいた。

ジャックとサラザール兄妹は、ウィルスの引き渡しに向かうニーナを捉えようと根回しを進める。ウィルスを押収しようと、チェイスとCTUのデルタチームは引き渡し場所に向かう。一方、パーマーは、ミリケンに対抗するために元妻シェリーを呼び戻す。

ジャックとサラザール兄妹は、ウィルスの引き渡しに向かうニーナを捉えようと根回しを進める。ウィルスを押収しようと、チェイスとCTUのデルタチームは引き渡し場所に向かう。一方、パーマーは、ミリケンに対抗するために元妻シェリーを呼び戻す。

ウィルスを落札したのはニーナだった。ジャックは、ウィルスの密売者、アマドールと接触するニーナを追う。一方、拷問に遭っていたチェイスを、ヘクターの恋人クラウディアが助ける。また、ウェインは、ミリケンの妻、ジュリアに嫉妬に怒る夫を説得するよう頼む。

ウィルスを落札したのはニーナだった。ジャックは、ウィルスの密売者、アマドールと接触するニーナを追う。一方、拷問に遭っていたチェイスを、ヘクターの恋人クラウディアが助ける。また、ウェインは、ミリケンの妻、ジュリアに嫉妬に怒る夫を説得するよう頼む。

競売でウィルスを落札しようとするジャックとサラザール兄妹。しかしそこにライバルが出現する。一方、ジャックを追っていたチェイスは、ラモンの手下に捕まり拷問にかけられる。パーマーの最大の支持者アラン･ミリケンは、妻と弟ウェインが不倫関係にあることを知り、ウェインを解雇するよう言う。

競売でウィルスを落札しようとするジャックとサラザール兄妹。しかしそこにライバルが出現する。一方、ジャックを追っていたチェイスは、ラモンの手下に捕まり拷問にかけられる。パーマーの最大の支持者アラン･ミリケンは、妻と弟ウェインが不倫関係にあることを知り、ウェインを解雇するよう言う。

一命を取り留め病院から戻ったトニーは、ジャックが再び麻薬組織に潜入するため、ガエルとともに密かに動いていたことを明かす。一方、ジャックはサラザール兄妹と、ウクライナ人科学者であるウィルス兵器の密売人との会談を取り持とうとする。

一命を取り留め病院から戻ったトニーは、ジャックが再び麻薬組織に潜入するため、ガエルとともに密かに動いていたことを明かす。一方、ジャックはサラザール兄妹と、ウクライナ人科学者であるウィルス兵器の密売人との会談を取り持とうとする。

シャペルは、ウイルス拡散の脅威は去ったことをスタッフに報告。一方、ラモンの信用を取り戻したジャックは、ラモンを連れメキシコへ飛ぶ。そんな中、CTU内では、スタッフのガエルがラモンと関係していることが発覚する。そして、チェイスはジャックを救い出そうと、単身メキシコへ向かう。

シャペルは、ウイルス拡散の脅威は去ったことをスタッフに報告。一方、ラモンの信用を取り戻したジャックは、ラモンを連れメキシコへ飛ぶ。そんな中、CTU内では、スタッフのガエルがラモンと関係していることが発覚する。そして、チェイスはジャックを救い出そうと、単身メキシコへ向かう。

カイルを確保したCTU。ラモンを連れて逃走中のジャックを止めようとするが、無線を切ってしまったジャックに連絡が取れない。そこに、CTUに乗り込んで来たシャペルが、本部の意向で自分が指揮を執り、軍にヘリの撃墜を要請すると告げる。

カイルを確保したCTU。ラモンを連れて逃走中のジャックを止めようとするが、無線を切ってしまったジャックに連絡が取れない。そこに、CTUに乗り込んで来たシャペルが、本部の意向で自分が指揮を執り、軍にヘリの撃墜を要請すると告げる。

パーマー大統領とキーラー議員の討論会が始まる。その頃、刑務所内は暴動騒ぎで混乱状態となる。ジャックはラモンを連れて脱獄を試みるが、2人は他の囚人に人質に取られてしまう。一方、CTUは逃走中のカイルを発見する。そして、キムとクロエは、ジャックが麻薬中毒になっていると気付く。

パーマー大統領とキーラー議員の討論会が始まる。その頃、刑務所内は暴動騒ぎで混乱状態となる。ジャックはラモンを連れて脱獄を試みるが、2人は他の囚人に人質に取られてしまう。一方、CTUは逃走中のカイルを発見する。そして、キムとクロエは、ジャックが麻薬中毒になっていると気付く。

CTUはカイルの行方を見失う。パーマーは、テロリストの要求は呑めないが、ウィルス拡散を黙って見過ごすわけにはいかない、と悩む。そんな中、ジャックは自らが刑務所へ押し入りラモンを脱獄させヘクターに引き渡そう、と提案する。

CTUはカイルの行方を見失う。パーマーは、テロリストの要求は呑めないが、ウィルス拡散を黙って見過ごすわけにはいかない、と悩む。そんな中、ジャックは自らが刑務所へ押し入りラモンを脱獄させヘクターに引き渡そう、と提案する。

ジャックは麻薬運び人のカイルのバッグから、ウィルスと思われる白い粉を発見する。一方で、カイル追跡から外されたチェイスはジャックに対し不満を募らせる。パーマーはアンが元夫の麻薬取引に関わっていたことを知る。カイルを捕らえようとしたトニーは、ラモンの弟ヘクターに打たれてしまう。

ジャックは麻薬運び人のカイルのバッグから、ウィルスと思われる白い粉を発見する。一方で、カイル追跡から外されたチェイスはジャックに対し不満を募らせる。パーマーはアンが元夫の麻薬取引に関わっていたことを知る。カイルを捕らえようとしたトニーは、ラモンの弟ヘクターに打たれてしまう。

衛生局に投げ込まれたウィルスに感染した死体は、麻薬ディーラー、ゴスのものだった。ジャックと若く優秀な相棒、チェイスはゴスの家へ急行。ジャックは娘キムとチェイスが付き合っていることを知る。再選に向けた討論会の準備で多忙のパーマー大統領。そんな中、弟ウェインがパーマーの主治医で恋人でもある、アンに関するスキャンダルを掴む。

衛生局に投げ込まれたウィルスに感染した死体は、麻薬ディーラー、ゴスのものだった。ジャックと若く優秀な相棒、チェイスはゴスの家へ急行。ジャックは娘キムとチェイスが付き合っていることを知る。再選に向けた討論会の準備で多忙のパーマー大統領。そんな中、弟ウェインがパーマーの主治医で恋人でもある、アンに関するスキャンダルを掴む。

本格的にCTUに復帰し、工作部門を率いているジャック。1年にも及ぶ潜入捜査の末、中南米の麻薬王ラモン・サラザールを逮捕したが、ジャック自らも麻薬中毒に苦しんでいた。そんな中、麻薬犯罪組織が、ラモンを6時間以内に釈放しなければ、恐ろしいウィルスをばらまくと脅迫してきた。

本格的にCTUに復帰し、工作部門を率いているジャック。1年にも及ぶ潜入捜査の末、中南米の麻薬王ラモン・サラザールを逮捕したが、ジャック自らも麻薬中毒に苦しんでいた。そんな中、麻薬犯罪組織が、ラモンを6時間以内に釈放しなければ、恐ろしいウィルスをばらまくと脅迫してきた。