【最終話】地球を滅亡させようとする、極悪最強の敵･クイーン。果たしてブルースワットはこの敵を倒すことができるのか。空が、大地が、地球が揺れ叫ぶ。ついに最終決戦が始まった。これですべてが決まる。そして伝説となる。

ついにジスプはブルースワットの手によって倒された。しかしクイーンは、その恐るべき最終作戦をついに発動。巨大彗星を地球に衝突させようと企む。それを防ごうと立ちはだかるブルースワット。スペースマフィアとブルースワットの最後の決戦が近づいていた。

ついにスペースマフィアの頂点に上りつめたキング･ジスプ。ジスプにひれ伏したシグと、クイーンがブルースワットを襲う。ショウとサラは、シグの目を覚ますことができるのか。そして、ブルースワット対ジスプの最終対決の幕が切って落とされた。

ジスプはスペースマフィアの科学者･ドクターアルドに命じて、自らの身体にある改造を施した。一方クイーンも、その恐るべき最終作戦に着手していた。そしてついに、ジスプがクイーンに反逆を開始。ブルースワットを交え、三つ巴の戦いが始まろうとしている。

処刑寸前に脱走したエイリアン、ジタンとコズマ。彼らの生きる道は逃げ続けることしかなかった。逃走中ブルースワットに助けられたジタンとコズマは、借りを返そうとスペースマフィアのアジトに忍び込む。そして、クイーンの最終作戦とは一体……。

ジスプが派遣したマニーの挑戦を受けるブルースワット。だが、ドラムガンファイヤーをはじめとするすべての武器のエネルギーが、マニーの作り出したメカに吸収されてしまう。そのとき、プラチナム出現。果たして、そのメカに太刀打ちできるのか。

ブルースワット打倒に燃えるジスプの次なる作戦は多重インヴェード作戦。数倍にもパワーアップした合体エイリアンが、ブルースワットに襲いかかる。しかし、それだけでは飽き足らないジスプは、ターゲットをシグに。そして……。

スペースマフィアのムッシュJがクイーンに無断で最強の電脳エイリアン･パルスを出動させた。パルスは核ミサイル基地に侵入しようと試みる。だが、何を間違ったのかパルスは虫歯の男にインヴェードしてしまい、激痛に襲われるハメに。

ショウが、サラが、セイジが、スミレが死んだ。地球はこのままスペースマフィアの手に落ちてしまうのか。ひとり残ったシグは新たな同志を得て、ショウたちの敵を討ち、スペースマフィア打倒を誓う。果たして、ブルースワットの逆転なるか。

突如現れた平和と幸せの女神･ティア。ティアは人々に希望の教えを説き、危険から守り、平和のために活躍するが、実はスペースマフィアの恐るべき罠だった。果たして、ブルースワットはこの罠を潰すことができるのか。

昆虫エイリアン･ブラハムの毒牙にかかり、倒れるシグ。ショウ、サラが駆けつけたとき、何故かシグは赤い血を流して倒れていた。シグは広瀬の身体を抜け出したのか。ブルースワットはスペースマフィアの陰謀を打ち砕き、シグを、広瀬を救うことができるのか。

スペースマフィアとの戦いを偶然目撃した、ルポライターの見城。彼はブルースワットとエイリアンの戦いを知り、自分も報道係として戦いたいと志願。一方スペースマフィアは、クイーンとジスプで罠を仕掛けようと企む。だが、ブルースワットと見城たちもさらに大きな罠を企んでいた。

遥か彼方から地球に落ちてきた不思議な歌を歌う小さな宇宙生物。それは、エイリアンの天敵と言われている、伝説のミール獣だった。スペースマフィアはその歌声に秘められた能力に怯えながら、ミール獣抹殺を企むが……。

ついに地球に降り立ったスペースマフィアの最高権力者･クイーン。そのクイーンの恐るべき最初の作戦。それはプラチナム抹殺作戦だった。一方ジスプは、先の戦いで傷を負った箇所を治すと同時に、自らを強化改造する。果たしてブルースワットは、プラチナム抹殺作戦を防ぐことができるのか。

スペースマフィアからの脱走者･ギムに怒りを震わせるジスプ。ギムに接触したショウは、そこでタイムマシンを使ったスペースマフィアの恐るべき計画を知る。しかしそのとき、ベールに隠されていたクイーンが、ついにその姿を現す。

ある日、サラが出会ったひとりの少年･祐太。彼はスペースマフィアに捕らえられた弟と妹を助けるため、サラとブルースワットの行動を追う。そして、人間を宇宙船のエネルギーに変えてしまう装置の恐怖が祐太の弟と妹に迫っていた。

ついにジスプは、スペースマフィアのマッドサイエンティスト、ドクター･ネロンを地球に呼び寄せた。人間を凶暴化させ、互いに殺し合わせる能力のあるネロンガス。ブルースワットは、そのネロンガスを使った恐るべき計画を防ぐことが出来るのか。そのとき、謎の怪人物が現れる。彼は敵なのか味方なのか。

次々と悪事を働くブルースワット。その正体は、デスキーラ3兄弟による偽者だった。偽者を追跡する、ショウ、サラ、シグ。そこでサラはひとりの男に再会する。その男、ケン石神は戦いなしでは生きられない宿命にあった。

ゴールドプラチナムがショウに贈ったプレゼント。その名は、ドラムガンナー。エイリアンたちの細胞を分解、消滅させることの出来る最強のエネルギーガンだった。これにディクテイターを装填すると、ドラムガンナー最強モード･ドラムガンファイヤーが完成した。

メカ寄生種族･モーグがメカやマシンにインヴェードし、ブルースワットを窮地に追い込んでいた。その決戦の最中、セイジの作った液体爆薬･RB-8がショウにかかってしまう。ショウ爆発までのタイムリミットは1時間。果たして中和剤を手に入れることはできるのか。

無敵の凄腕エイリアン･ゲドンが地球にやってきた。その圧倒的なパワーに翻弄されるブルースワット。だが、無敵のゲドンには凶悪な宇宙バクテリアが寄生していた。恋女房･ハルとともに逃走を開始したゲドン。そして、そこにはジスプの罠が仕掛けられていた。

シルバニック･ギアの登場により、辛くも窮地を脱出したブルースワット。だが、壊滅宣言を誓ったジスプと内部監察官･エバの前に、ストライカーがついに大破。そしてジスプは、ザジの身体を葬り去ろうとしていた。そのとき、青く蘇ったストライカーが出現し、救出に向かう。

真夏の夜に次々と起こる怪奇現象の数々。心霊、呪い、悪霊がブルースワットを困惑させる。彼らはこの現象の裏に隠された真実を暴くことができるのか。そして、再びショウの怒りが爆発するとき、新たなる力がショウの身体を包んだ。

セイジの学生時代の親友、シンヤの母が危篤に。必死にシンヤを捜すセイジだったが、なかなか見つからない。一方、スペースマフィアのムッシュ･ザジは、死刑囚グラガを使ってブルースワット壊滅を企んでいた。

腹心の女幹部･ヤニミを失ったザジは一気にブルースワット壊滅計画を進行。それを阻止せんと立ち向かうブルースワットだったが、戦いの中でショウが行方不明に。そして再び現れたショウは、何故かサラ、シグに銃口を向けた。

突然、現代に現れた浦島太郎。彼は助けた亀に連れられて竜宮城に行ってきたという。だがそこには、エイリアンの恐るべき陰謀が隠されていた。ブルースワットは、謎が謎呼ぶ浦島伝説の真相を暴くことができるのか。

正体不明の怪電波。それは、スペースマフィアの恐怖電波発生装置によるものだった。恐るべきエイリアンの陰謀を阻むため出動するブルースワット。しかし、ショウとサラが恐怖電波にやられてしまう。窮地に追い込まれたブルースワットは電波の発信源を探すが、三人の少年たちも同じ発信源を追っていた。

ショウの怒りが時間を超え、空間を超え、ゴールドプラチナムを呼び出した。地球侵攻作戦を潰すべく、2大ヒーローが手を結ぶ。だが、スペースマフィアはエイリアンたちだけでなく、鬼塚と傭兵たちを使った二重の罠を企てていた。勝利はどちらに……。

果てしなく続く、ブルースワットとエイリアンの激しいバトル。ついにザジはブルースワット壊滅作戦を発動させた。絶体絶命の危機に陥るブルースワット。ザジの卑劣な作戦にショウの怒りが爆発する。そのとき、時空の壁を超えて、金色の戦士が舞い降りた。

ある宇宙人がシグを呼んでいた。彼の目的はJ-3000という、地球人以外には猛毒である花を繁殖させることだった。それができれば、スペースマフィアを追い出すことが出来る。だが、同時にシグも地球にいることが出来なくなってしまうのだった。