ベレッカは街で大人の姿のバートンを目撃する。ベレッカたちはバートンが大人の姿に戻るためのスムージーを完成させたのではないかと考え、バートンを捜しにアジトへ向かうが、バートンの姿はなく...。

ベレッカが街を歩いていると、大人の姿のバートンを目撃する。大人のバートンはベレッカに気付くと驚いた表情を見せ、その場から一目散に逃げてしまった。バートンが大人の姿に戻るためのスムージーを完成させたのではないかと考えたベレッカたちは、バートンを探しにアジトへ向かうが、バートンの姿は無く、飲みかけのスムージーだけがあり、残りをベレッカが飲んでみるが…

ランチに特製ビーフシチューが出ると大はしゃぎのバーンとカッペイがそのことをキースに話すも、反応はイマイチ。その様子をみんなに話すと、ベレッカたちもここ数日のキースのおかしな様子を目撃していて...。

ランチメニューに特製ビーフシチューが出ると大はしゃぎのバーンとカッペイ。興奮してそのことをキースに話すも、反応はイマイチ。その様子をみんなに話すと、ベレッカたちもここ数日のキースのおかしな様子を目撃していて、その様子から何か事件に巻き込まれているのではないかと推察したバートンたちは、キースの尾行を決行する！しかしキースの行先は意外な場所で…

密輸団の犯行現場に現れたスカルニンジャと名乗る怪しい男。ニュースでスカルニンジャを見たロンは、授業を欠席し、行方をくらます。心配になったバートンたちは、御庭番衆時代のロンの情報を調べることに...。

密輸団の犯行現場に現れたスカルニンジャと名乗る怪しい男。ニュースでスカルニンジャを見たロンは何か思い当たる節があるようで、授業を欠席し、行方をくらます。心配になったバートンたちは、御庭番衆時代のロンの情報をハッキングして調べることに。一方ロンは情報屋でスカルニンジャの情報を仕入れ、彼と接触を試みるが…

連休にルーシーの地元へ帰ることになったルーシーとエマ。母親から友達のクロエがピアノのコンクールに出場することを知らされたルーシーは、影ながらクロエを応援することにするが、クロエの演奏には元気がなく...。

連休にルーシーの地元へ帰ることになったルーシーとエマ。二人が駅に到着すると、そこでルーシーは友達のクロエの姿を見かける。母親からクロエがピアノのコンクールに出場することを知ったルーシーは、影ながらクロエを応援することに。しかし聞こえてきたクロエのピアノの演奏には元気がなかった。ルーシーとエマはその原因を探ることに…

バートンたちからおもちゃを与えられ、ゴローとガムッチは大喜びする。だが、そのおもちゃが引き金で2人の仲に亀裂が入ってしまい、エゼットが心配する。その頃、アカデミーの畑が荒らされる事件が発生し...。

バートンたちにおもちゃを与えられ、大喜びのゴローとガムッチだったが、そのおもちゃが引き金で二人の仲に亀裂が入ってしまう。そんな様子を心配するエゼット。そのころアカデミーの畑が荒らされる事件が発生。そこに猫の足跡があったことからゴローがその犯人でないかと疑われていた。一方、ガムッチは自分が悪かったことに気づき仲直りをするためにゴローを探すが…

ウォーレンが作った、渾身のWNAのPR動画。バートンたちはその動画の試写をするが、インパクトが薄い動画に、生徒たちはあくびを連発。そこで校長は、「生徒たちにPR動画を作らせてみては?」と提案し...。

ウォーレンが作った、渾身の「WNA」PR動画。動画の試写をするバートンたちであったが、あまりにもインパクトが薄い動画に、生徒たちはあくびを連発。そんな生徒らの様子を見てショックを受けるウォーレン。そこで校長は、「生徒たちにPR動画を作らせてみては？」と提案し、アカデミーでの動画バズらせ対決が始まったが、次第に動画の内容はWNAと関係ないものになっていき…

早朝、バーンは浮かない表情でバスケの練習をしていた。ダンの「ニンジャの修行一本に絞れば、もっと強くなれるんじゃないか」という言葉が引っかかっていたのだ。そんな時、バーンは少女・パティと出会い...。

早朝、バーンは浮かない表情でバスケの練習をしていた。ダンに言われた「ニンジャの修行一本に絞れば、もっと強くなれるんじゃないか」という言葉が引っ掛かっていたのだ。そんな時、ランニングをしていた少女パティと出会う。2人が会話をしていると、どこからか神秘的な歌声が聞こえてきた。2人が声の主を探しに川辺を歩いていると、なんと人魚のような影を見つけて…

ブルースの提案により、生徒たちは変装術を身につけるべくほかの誰かに変装をし、一日を過ごすという特別授業を受けることに。しかし、変装はなかなかうまくいかず、授業はしっちゃかめっちゃかに...。

ブルースの提案により、生徒たちは変装術を身につけるべく他の誰かに変装をし、その人になりきって一日を過ごすという特別授業を受けることに。ロンに変装したエマは、メイからニンジャラバトルを申し込まれたり、ベレッカになったバートンと、バートンになったベレッカが出会って大混乱！さらにはルーシーが三つ子になったりと授業はしっちゃかめっちゃかに！

お忍びでコメリカへやってきたドコナ王国のダレデス国王とその家族。彼らは秘密結社・ドコドコ団に命を狙われていた。そのため、ロンとジェーンはウォーレン、マレット、バケットと彼らの護衛の任務に就くことに。

お忍びでコメリカへやってきたドコナ王国のダレデス国王とその家族。彼らはなんと、秘密結社ドコドコ団に命を狙われていたのだ。そのため、ロンとジェーンはウォーレン、マレット、バケットと彼らの護衛の任務に就くことに。国王たちを守るため、さらに娘のダレダ王女の希望を叶えるため、ロンとジェーンは奔走するが、ダレダ王女の希望はなかなか一筋縄ではいかず…

夜、カッペイはアカデミーの食糧庫で恐ろしい目と鋭い牙を持つ“何か”に遭遇する。食堂のおばちゃんに聞くと、最近、食材がなくなっているという。そこで、カッペイたちは食糧庫に現れる“怪物”退治をすることに。

夜、アカデミーの食糧庫でカッペイは恐ろしい目と鋭い牙を持つ“何か”に遭遇。食堂のおばちゃんに聞いた話によれば、最近、食材が無くなっているという。食糧庫に現れる“怪物”退治をすることにしたカッペイ達。悪戦苦闘の末に“怪物”を捕まえようとすると、なんとその正体は子供のワニだった。カッペイとバーンはワニをもとの飼い主のもとへ送り届けることになるが…

食堂から漏れ聞こえてきたブルース、エイミー、食堂のおばちゃんの会話を聞き、デイジー先生がやめると思ったバーンとカッペイは、バートンたちと、デイジーが受け持つクラスのボトルコレクターズに報告する。

食堂から漏れ聞こえてきたブルース、エイミー、食堂のおばちゃんの会話を聞き、デイジー先生が辞めると思ったバーンとカッペイは、すぐさまバートンたちと、デイジーが受け持つクラスのボトルコレクターズに報告。メイやキースには思い当たる節があった。生徒らの不安や心配を解消するためにベレッカとバートンはデイジー先生を尾行することに、そこで目撃したものは…

ミステリー小説を読み、謎解きに目覚めたベレッカ。そんなベレッカとバートン、エゼットが歩いていると、仰向けで倒れているカッペイを発見。それを見るや、「事件ね」とベレッカはわくわくし始め、捜査を開始する。

ミステリー小説を読み、謎解きに目覚めたベレッカ。そんなベレッカとバートン、エゼットが歩いていると、仰向けで倒れているカッペイが！それを見るや「事件ね」とベレッカはワクワクし始め、捜査を開始。そこにエマとジェーンもやって来て、みんなで盛り上がり始める。倒れているカッペイの傍には、はんぺんとニンニクが落ちていた…そしてベレッカの名推理が始まる！？

食堂で、ほかのクラスの生徒が「バーンとカッペイはどちらが強いか」と話していた。それを聞いていたバーンとカッペイは、対抗意識を燃やす。そんななか、ブルース考案の大運動会が開かれることに...。

食堂で、他のクラスの生徒が「バーンとカッペイはどちらが強いか」と話していた。それを聞いていたバーンとカッペイは互いに対抗意識を燃やす。そんな中、ブルース考案の「風林火山」にちなんだ大運動会が開かれることに。2チームに分かれて対決することになり、バーンとカッペイはそれぞれ大将に就く。しかし大将になった2人の対応はあまりにひどく…

バートンの発明品で迷惑を被ったとベレッカ、ジェーン、ロンが怒ってバートンのもとへやってくるが、バートンは苦情を言われても意に介さない。そんななか、バートンのもとに新たな発明依頼が入る。

バートンの発明品で迷惑を被ったとベレッカ・ジェーン・ロンが怒ってバートンのもとへ、しかしバートンは苦情を言われても「どんな失敗も、新たな一歩」と意に介さない。そんななか、バートンのもとに新たなカラクリロボ発明依頼が入る。その内容は「狙った獲物は逃さず捕え、身体はどんな攻撃にも耐え、その場の状況に応じて臨機応変に行動できる」という怪しいものだった…

WNAの総務本部長・ウォーレンは、同じくWNA幹部のマックスとレナードと比べると自身が役に立てていないのではないかと悩みを抱えていた。さらに幹部会議では、2人のどちらの意見を採用すべきか決定権を託され...。

WNAの総務本部長であるウォーレンはさまざまな業務こなし、忙しい日々を送っていた。しかし、ウォーレンは同じくWNA幹部のマックスとレナードと比べると自分が役に立てていないのではないかと悩みを抱えていた。さらに幹部会議では、マックスとレナードどちらの意見を採用すべきかウォーレンに決定権を託される始末。そんな状況を悟ったエマは、ウォーレンを街に連れ出すことに…

釣りをするため、宇宙船で湖にやってきたバーン、カッペイ、エゼット。一緒に楽しんでいたガムッチとゴローだが、釣りを終えたエゼットが宇宙船を発進しようとした拍子に2人はハッチから外へ放り出されてしまう。

釣りをするために、エゼットの宇宙船で湖にやってきたバーン、カッペイ、エゼット。一緒に楽しんでいたガムッチとゴローだったが、釣りを終えたエゼットが宇宙船を発進しようとした拍子にハッチから外へ放り出されてしまった！見知らぬ土地に投げ出されてしまったガムッチとゴロー。果たしてガムッチとゴローは無事WNAアカデミーに帰ることができるのか…

街中でジェーンに声をかけてきた男は、「昔、よく組んで仕事をしたハリー」だと名乗る。何とかその場を切り抜けたジェーンは、バートン、ロン、ベレッカに、「ハリーが復讐をしにきたのかもしれない」と相談する。

街中でジェーンに声をかけてきた男、その男は「昔、よく組んで仕事をしたハリー」だと名乗る。なんとかその場を切り抜けたジェーンは、バートン、ロン、ベレッカに、「正体がバレてしまった、ハリーが自分に復讐をしに来たのかもしれない」と相談する。ジェーンの代わりにハリーの目的を探るため、ハリーがいるホテルへ潜入しようとするが…

とある会社で、エドモンドという男が社長からクビを言いわたされた。意気消沈のエドモンドがハンバーガーショップに立ち寄ると、手にテディベアを持った3人のギャングが現れる。ルーシーは偶然そこに立ち寄るが...。

とある会社ではエドモンドという男が社長からクビを言い渡された。意気消沈のエドモンドがハンバーガーショップに立ち寄ると、手に可愛いテディベアを持った3人のギャングが現れた！偶然そこに立ち寄ったルーシー。楽しそうなスポーツをしていると勘違いしたルーシーは、なんとギャング団に加入してしまう！？さらにエドモンドもギャング団に加入することになってしまい…

ある日、カッペイはオエドに住む祖父・源雲斎が覆面ニンジャたちにさらわれ、助けを求めるという夢を見た。源雲斎の身に何か起きているのかもしれないとエゼットに言われ、カッペイは源雲斎に電話をかけるが...。

ある日カッペイは、オエドに住む祖父の源雲斎が覆面ニンジャたちに攫われ、カッペイに助けを求めるという夢を見た。それは本当に源雲斎の身に何かが起きているのかもしれないとエゼットに言われ、源雲斎に電話を掛けるも繋がらない。心配になったカッペイはフンドルケットルでオエドに向かうが、そこに源雲斎の姿はなく、謎の書置きだけが残っていた…

WNA諜報部に所属するロジャーに連れられ、息子・アレクがWNAアカデミーに転入してきた。ロジャーはバーンの父・マックスの幼馴染みでありライバルであった。そのことから、アレクはバーンを意識していた。

WNA諜報部に所属するロジャーに連れられ、WNAアカデミーに転入してきた息子のアレク。ロジャーはバーンの父マックスの幼馴染でありライバルであった。そのことから、アレクはバーンを意識していた。授業の一環でアレクとバーンはニンジャラバトルで戦うことに。初めてのニンジャラバトルなのに、余裕の表情を見せるアレクに、バーンは闘争心を燃やす…

源柳斎の計らいで、生徒たちとエイミー、デイジーは無人島でのんびりすることに。無人島へ到着し、それぞれが砂浜で思い思いに楽しむ。バーンとカッペイが釣りを楽しんでいると、古びた宝の地図が飛んできて...。

源柳斎の計らいで、生徒たちとエイミー、デイジーは無人島でのんびりすることに。無人島へ到着し、それぞれが砂浜で思い思いに楽しむ。岩場で釣りを楽しんでいたバーンとカッペイのもとに古びた宝の地図が飛んできた。それはなんと宝の地図！かつての大海賊、キャプテン・ウイローのお宝をめぐるトレジャーハントが開幕する！

メルウス星に平和を取り戻し地球に向かうバートンたち。一方、アカデミーでは再び生徒会選挙が行われようとしていた。生徒会長になりたいダンは、バートンたちが帰ってくる前に選挙を終わらせようと画策するが...。

メルウス星に平和を取り戻し地球に向かうバートンたち。一方、アカデミーではダンを筆頭に、再び生徒会選挙が行われようとしていた。どうしても生徒会長になりたいダンは、バートンたちが地球に帰ってくる前に選挙を終わらせようと画策するが、予想外に早くバートンたちが帰還することを知りあの手この手でバートンたちを足止めする。さらにダンには秘策があり…

エマたちが地下の水源を解放したことでスペースニンジャは街の外に追い出され、街には水が行き渡った。みんなはその美しい光景が広がる街の姿に感動し、スペースニンジャの脅威から街を取り戻したかに思えたが...。

エマたちが地下の水源を解放したことでスペースニンジャは街の外に追い出され、街には水が行き渡った。皆はその美しい光景が広がる街の姿に感動をし、スペースニンジャの脅威から街を取り戻したかに思えたが、水中から突然、ガムゴゼンが襲撃してくる。そしてメルウス星を取り戻す最後の戦いが始まる…

オデット率いる部隊が大聖堂の封鎖に成功したことで、外にいるスペースニンジャの数は全体の半分になった。バートンたちと共に各地区で戦闘をする部隊は次々にスペースニンジャを倒し、戦況は有利に傾くが...。

オデット率いる部隊が大聖堂の封鎖に成功したことで外にいるスペースニンジャの数は全体の半分になった。そのことを機に他の三部隊もシティに突入し、街を取り戻すための戦いが始まる！バートンたちと共に各地区で戦闘をする部隊は次々にスペースニンジャを倒し、戦況は有利に傾く。しかし、大聖堂に閉じ込められたスペースニンジャのボスがついに動き出して…

スペースニンジャに占領されたシティを取り戻すため、4つの部隊に分かれたバートンたちとメルウス軍。ジェーンとロンはオデット部隊に同行し、ジェーンが場を和ませようと話しかけるが、オデットは無視し...。

スペースニンジャに占領されたシティを取り戻すため、四つの部隊に分かれた、バートンたちとメルウス軍。ジェーンとロンはオデット部隊に同行することに。ジェーンが場を和ませようと話しかけても無視をするオデット。さらに部下であるキャロットが話しかけても冷たい態度を取る。不満を募らせるジェーンだったが、実はオデットには秘密があって…

スペースニンジャ殲滅作戦のため、部隊を4チームに分けて拠点へと向かうことに。バートン、ベレッカ、エゼット、ガムッチはジベット部隊に同行するが、目的地へ向かう途中、バートンたちは何者かの視線を感じ...。

スペースニンジャ殲滅作戦のため部隊を4チームに分け、それぞれシティ周辺の拠点へと向かうこととなった。バートン、ベレッカ、エゼット、ガムッチはジベット部隊に同行することに。スペースニンジャに注意しながら目的地へ向かう途中、バートンたちは何者かの視線を感じる。さらに怪しい行動をとるジベットを目撃して…

スペースニンジャの数と配置を掴むための偵察をバーン、カッペイと一緒に成功させたロビット。その結果を受け、スペースニンジャのせん滅作戦が行われることになり、バートンたちは作戦への同行が許可される。

スペースニンジャの数と配置を掴むための偵察をバーン、カッペイと一緒に成功させたロビット。その結果を受け、スペースニンジャの殲滅作戦が行われることになった。そこでエゼットはバートンたちの協力を提言し、ガボット将軍はバートンたちの作戦への同行を許可する。作戦はオデット隊、ジャーケット隊、ロビット隊、ジベット隊の4チームに分かれて行うことに…

スペースニンジャを倒すためにメルウス星にやってきたバートンたちだが、メルウス軍は地球人の協力は必要ないと言う。自分たちが戦力になることを示すため、バーンとカッペイはメルウス軍のロビットと戦うことに。

スペースニンジャを倒すためメルウス星に来たバートンたちだったが、地球人の協力は必要ないと言うメルウス軍。自分たちが戦力になることを示すため、バーンとカッペイはメルウス軍の精鋭であるロビットと戦うことに。圧倒的な強さを見せるロビット。そんなロビットを倒すためバーンとカッペイは作戦を考える。

バートンたちを乗せた宇宙船は、ついにエゼットたちの故郷・メルウス星へたどりつく。そこは一面に砂漠が広がる星だった。メルウス星唯一の都市へ向かうため、フンドルケットルは砂嵐の中を突き進むが...。

バートンたちを乗せた宇宙船は、ついにエゼット達の故郷、メルウス星へたどり着く！そこは一面に砂漠が広がる星だった。メルウス星唯一の都市へ向かうため、砂嵐の中を突き進むフンドルケットル。砂嵐を抜け到着した都市は、なんと何者かに破壊されていた。破壊された都市を見て、唖然とするバートンたちの前に現れたのは…

バートンたちを乗せ、エゼットたちの故郷・メルウス星を目指して宇宙空間を進む宇宙船。その船内で授業を行おうとするブルースだが、宇宙にきてまで授業を受けたくないルーシーたちは思い思いの宇宙旅行を満喫する。

バートンたちを乗せ、エゼットたちの故郷メルウス星を目指して宇宙空間を進む宇宙船。その船内で授業をおこなおうとするブルースだが、宇宙に来てまで受けたくないルーシーたちは思い思いの宇宙旅行を満喫する。そしていよいよメルウス星へ向けて、サクットチケットドライブ（ワープ）を起動！しかしワープを抜けた先はメルウス星ではなく、なぜか小惑星帯で…