【最終話】魔女参謀の変身したジンドグマ超A級怪人マジョリンガーが出現する。やがて、悪魔元帥は、B26暗黒星雲からやって来た怪人サタンスネークの正体を暴露する。その一方で、宇宙開発用ロケット･ジュピタースーパー1号を奪い、宇宙から地球を攻撃しようと企むのであった。危うし! スーパー1!!

幽霊博士から変身したジンドグマ怪人ゴールドゴーストは、自らが放つ金色の猛毒カビを空から降らせることで、人々を黄金病に感染させるようと試みる。これによって、なんら罪のない沖一也に、罪を被せようと企むのであった。

遂に真の姿であるジンドグマ超A級怪人へと変身する大幹部たち。その一方で、鬼火司令はジンドグマ怪人オニビビンバに、さらに妖怪王女はジンドグマ怪人サタンドールへと姿を変え、そしてスーパー1との最後の決戦に挑むのであった…。

少林寺拳法の稲妻拳の達人であるジンドグマ怪人ショオカキングは、鬼火司令が計画した東京ドロドロ作戦を成功させるため、邪魔な存在となるスーパー1の抹殺の指令を受ける。必殺武器である口のマグナムガンに苦戦するスーパー1、危うし!

妖怪王女配下となるジンドグマ怪人ハシゴーンは、宇宙開発研究所の栗田博士が発明したという水素爆弾よりも強力だという新しい超高性能ロケット燃料Xベーターを奪おうと目論む。ニョキニョキと伸びる魔の手が、スーパー1を襲う!

魔女参謀の配下であるジンドグマの扇風機怪人ゴールダーは、日本中を氷詰めにするための指令を受ける。そのために必要となってくる窒素ゴールダーを完成させた世界的権威の物理学者である尾崎博士を狙うのであった。

無数のボールに分離、合体して巨大なボールに変身するジンドグマ怪人ドクロボールは、ドクロ山荘で開催されることになっている悪魔元帥の仮装パーティーに誘き出されて現れたスーパー1と対決する。危うし、スーパー1!

キイロックパワーを使うジンドグマの鍵怪人キイマンジョーは、マジックショーのジョー吉田へと変装し、スーパー1を倒す機会をを狙う。そして、魔女参謀の命令を受け、沖一也を水中檻に閉じ込め、処刑しようと企むのであった。

ジンドグマ怪人シャボヌルンは、幽霊博士の発明した特殊な石けんで、人間をゼリー状に溶かしてしまい、一旦下水道に流した上で回収し、新たに人間への再生を図るといった手口で、人間たちを奴隷化し兵士にする石けん作戦を企む。

鬼火司令の命により、ジンドグマ怪人フランケライターは、頭部のファイヤーストーンで発火させた火炎で街を焼き尽くすといった火事地獄作戦を実行しようとする。そして、東京を一挙に全滅させるために、フォンダ博士に命じて、フランケライター2号、3号の完成を急がせる。

幽霊博士が考案した四次元トンネル作戦を実行に移そうとするジンドグマの冷蔵庫怪人コゴエンベエは、子供たちに理想の国･ユートピアンを見せて、ジンドグマの絶対的支持者として忠誠を誓わせ、兵士として駆りたてようとするのだった。

鬼火司令の命令により岬灯台を占領したジンドグマ怪人コマサンダーは、海上を通過する石油タンカーをコマ爆雷で撃沈しようとする。何故なら、潮の流れを利用して、東京湾を火の海にしてしまおうという東京湾火の海作戦を実行するためだったからだ。

ハサミを自在に操って人々を襲い、両手のハサミで何でも切断するジンドグマ怪人ハサミンブラッドは、ピエロのピエローヤに化けて暗躍する。というのも、鬼火司令の命令に従い、東京全域に大混乱を生じさせ、その機に乗じて、一挙に占領しようと試みる。

ジンドグマ怪人イスギロチンは、幽霊博士の発明したドクロガス (5秒で人間を溶かす威力を持つ) の秘密研究所主任だった脱走者の大田吾郎を捜し出す使命を帯びる。電気イスの体を持ったイスギロチンの処刑執行が迫る。

パトカーの赤ランプを頭部に付けたジンドグマ怪人レッドデンジャーは、妖怪女王の作戦命令に従い、赤ランプやサイレンを使って街を混乱に陥れる。これによって、恐怖と不安に陥った人間たちを互いに憎み合わせようと計画する。

ラジコンを使って、毒ガスの散布を目論む幽霊博士の作戦を遂行するために、ジンドグマ怪人ラジゴーンは、ラジコン飛行機やラジコン自動車を、自ら発する怪電波を使い、自由自在にコントロールしてしまい、人々を混乱に陥れるのであった。

釣り竿怪人ツリボットが、魔女参謀の作戦命令を実行する。その作戦とは、古賀国防長官の息子である慎一を人質にして、ミサイル秘密基地の場所を聞き出し、そこをジンファイターが占領する。そして、奪ったミサイルで日本中を火の海にしようと目論む…。

妖怪女王の作戦命令に従い、ジンドグマスプレーで人間を泡状の液体に変えて吸い込み、洗脳してしまう怪人スプレーダーは、自らも地獄スプレーで、スーパー1を襲撃する。手足を体に納めた回転攻撃で、スーパー1の抹殺を図る。

ローラースケートを楽しむ人々に魔の手が迫る。猛スピードで疾走する怪人マッハローラーは、鬼火司令の命令により、走り出したらと止まらないローラースケートを人々に履かせ、ジンドグマ･ローラースケート部隊を結成しようと企むが…。

自由に雨を降らせることができる妖怪王女の部下、そんな雨男の正体とは一体!? それは、ジンドグマ怪人アマガンサーだった。アマガンサーは、ジンドグマの超科学チームに造らせた人間コントロール装置を雨傘に仕込み、人々を洗脳して、武器を持たせようとする。

人間や物体をカメラで写し、ビデオテープに閉じ込めてしまうビデオ怪人ビデオン。魔女参謀の命令により、大勢の世界的科学者たちを誘拐し、殺人研究所へと送り込む。そして、この科学者たちに様々な殺人兵器を完成させようとする。

妖怪女王の作戦を実行するメガネ怪人グラサンキッドは、子供の味方･チャイルドXに化けて子供たちを騙し、大人に反抗するX軍団を結成させる。これによる世の中の混乱に乗じて、子供たちを利用して日本征服を企むのだった。

町の古時計とジンドグマの火砲時計を交換し、東京を一瞬にして、火の海にしようとする幽霊博士の作戦を実行に移す時計怪人の火焔ウォッチ。ジンドグマのアジトの時計塔の針が12時を告げる時、東京は一瞬にして火の海になってしまう…。戦え、スーパー1!

航空会社を支配下において、日本の制空権を握ろうと企む鬼火司令の作戦を実行する金属ならなんでも吸い寄せる怪人ジシャクゲンは、東西航空へ脅迫状を送り、飛行機、さらには飛行場すべてを引き渡すように命令してくるのであった…。

闇の王国ドグマを壊滅させるものの、新たに悪魔元帥率いる謎の新組織ジンドグマが出現する。その怪人第1号となるキラーナイブは、原子物理学者の木谷教授を脅迫し、ジンドグマのために、原子十字砲を製造させようとする…。

帝王テラーマクロが、守護神の像に流れる血を浴びて変身した不死身の怪人カイザーグロウ。そのため、如何なる攻撃にも屈しないカイザーグロウの猛攻に苦戦する一也。そんな彼を救うために、玄海老師や弁慶たちは、ドグマのアジトである霊山へと向かう。

5年前に宇宙開発用の改造人間手術の失敗によって醜い姿に変貌してしまった国際宇宙開発研究所の秘密研究員の奥沢正人。そんな彼の正体は、なんとメガール将軍であり、そしてもう一つの姿とは死神バッファローであった…。

ドグマ怪人バチンガルは、メガール将軍の命によりドグマ超医学班がスーパー1の能力を分析して生み出した最強怪人であった。だが、唯一欠けているファイブ･ハンドを得るために、ハルミと良を蜂の巣城へと誘拐し、スーパー1を誘き出すのであった…。

ツタを使ってビルの谷間を自在に移動する電話怪人ツタデンマは、日本中の電話に発狂音波を流すため、電話センター占領計画を実行する。中央電話センターの東山局長の一人娘ヒロコを誘拐し、その引き換えに、センターのマスターキーを要求するが…。

胸部のカセットを交換する事によって破壊音波、幻覚音波、催眠音波を使い分ける怪人カセットゴウモルが、DGM学習塾の子供たちを催眠学習で洗脳する。そして、子供たちにドグマ幹部候補生のエリート教育を受けさせようとするが…。