【最終話】ボーボボと田楽マンが、スーパー田ボに聖鼻毛融合! 裏マルガリータ四天王･3ぶくろ2と死闘を繰りひろげる。その頃マルガリータ城内では、決定戦参加者たちが、裏の四天王･クリムゾンとLOVEに襲われていた!

ツルリーナ4世は、新皇帝決定戦にそなえて、妻のマコちゃんから宇宙エネルギーを吸収していた! その頃、地底にある裏マルガリータ帝国では、闇皇帝ハイドレートが立ち、地上侵攻を叫んでいた!

裏マルガリータ四天王･ハロンオニの闇力を注入されて、ヘッポコ丸が巨大化してしまった! さらにハロンオニの部下･スリムが、ボーボボたちを襲う! その時、旧Aブロック隊長･ハンペンが現れた!!

ギガやハレクラニなど、かつて戦った戦士も集まり、ついに、マルガリータ帝国新皇帝決定戦が始まった。1次予選の相手は、マルガリータ帝国最高幹部･闇夜叉! ドクロ刀から放たれるドクロ真拳が、ボーボボたちをねらう!!

暗殺部隊総隊長･ねんちゃくのSTOP真拳を受けて、ボーボボ、首領パッチ、天の助が溶けてしまう。しかし3人は合体して、変な生き物になった! 幻のチェーンソー真拳で反撃開始だ!

50年に1度の、新皇帝を決める頂上バトル･マルガリータ帝国新皇帝決定戦が開催される! ボーボボたちは、大会をぶっつぶすべく、会場があるエジプトへ向かう!

人間をゴミ呼ばわりするツル･ツルリーナ3世に、鼻毛真拳超絶奥義「鼻毛発人間超特急」を発動! それにより、人間の一生を目撃することになった彼は、人生が作りだす無限の力を思い知る!

ツル･ツルリーナ3世の青藍の手品真拳を受けて、精神を破壊されたボーボボは、アフロをちぎりだす。勝利を確信したツル･ツルリーナ3世のまわりで、ちぎられたアフロが、ボーボボの姿に変化していく!

先代皇帝ツル･ツルリーナ3世が目覚めてしまった! さらに今まで協力していた魚雷ガールが、ボーボボの敵、OVERに戻ってしまった! 3大真拳使いの激闘が始まる!

人を傷つけることなんてできない、と言いながら、天ボボはハンペンを思いっきり傷つける。そして奥義「平和願望7条約」を投げかけ、すさまじい攻撃を、次々と繰りだしていく!

天の助は、旧Aブロック隊長･ハンペンに食バトル頂上対決を挑むが、1秒で倒されてしまう。天の助が沈むおでん鍋に飛び込むボーボボ! 突然パクパクと天の助を食べたかと思うと、融合してしまう!

次のバトルステージを目指すボーボボたちの前に、旧Aブロック隊長･ハンペンが現れた。その巨大な姿に、ボーボボはビビリまくり! そこへ魚雷先生にかつがれた、破天荒が現れた!!

ボーボボの「レトロ･ゲーム･プレイング」で、旧Bブロック隊長･ランバダがドット絵になった! ポリゴン真拳を封じられたランバダは、レトロゲームのきびしさを体感する!

旧Dブロック隊長･レムの最大奥義を破り、ボーボボは、鼻毛真拳奥義「聖鼻毛悪夢領域」を発動! 愛とロマンの超次元感動空間で、レムの汚れきった邪悪な精神を浄化する!

レムの「レム･スリープワールド」を受けて、ボーボボたちは、夢の中の世界に引き込まれた! 一方の現実世界では、首領パッチと旧Rブロック隊長のイシカワ･ゴエモンが、死闘を繰り広げていた。

ひとりぼっちになってしまったビュティの前に、爆睡真拳を操る、旧Dブロック隊長･レムが現れた。その時、2人目の助っ人･サービスマンが参上! サービスと爆睡真拳の激闘が始まる!

旧Zブロック隊長･泡玉のルブバの罠にかかり、ビュティはボーボボたちと離ればなれになってしまう。彼女を助けるため、ボーボボは二人の助っ人を呼び出す。一人目は、元キング･オブ･ハジケリストのライスだ!!

首領パッチが、ボーボボのボボパッチシステムを、勝手に動かして誕生した、パッチボボ! “物質ハジケ融合”で、強力な武器を造り出す。風神のジェダも、仲間の覇凱王と合体して戦う!

旧Cブロック隊長･風神のジェダの攻撃を受けて、天の助が氷の中に引き込まれてしまった。ボーボボは、首領パッチとの聖鼻毛融合を発動! しかし首領パッチは、ボーボボの体内の司令室を乗っ取る!

トラップ真拳がボーボボに全く通じない、旧Eブロック隊長のコンバット･ブルースは、世界最強の武器が入る、武器ボックスを手にする。しかし、その中から出てきたのは魚雷先生だった!

“3狩リヤ”の戦闘態勢でボーボボたちと闘う、旧Fブロック隊長･宇治金TOKIOたちは、鼻毛真拳究極奥義･超常現象7トラベラーで、世界各国の超常現象を体験する!

旧A、B、C、E、Fブロックの隊長たちが目覚めた! それを機に無数の旧隊員たちが出撃する!! しかし、破天荒を加えたボーボボたちは強すぎた。なぜなら3つの派に分かれ、力を競っていたからだ!

旧Gブロック隊長･薔薇百合菊之丞が、巨大な薔薇で相手を喰らう「薔薇喰蛇」で襲いかかってくる! 免許皆伝の証、黒いジャンパーをまとったスーパーボーボボが、今こそ愛の力で反撃する!!

ボーボボたちは、旧毛狩り隊5人を奥義で撃破した! しかしソフトンは、「ヤツらはただの隊員だ」とつぶやく。ボーボボたちは激しくなる戦いに備えて、真拳使いをパワーアップさせる聖地エターナルへ向かう。

ボーボボの激進を止められないツル･ツルリーナ4世のもとに、驚愕のニュースが届く。ツルリーナ3世世代が、100年間の封印から目覚めたのだ。旧毛狩り隊が、毛の王国の生き残り･ボーボボをねらう!!

ギガがオブジェのパワーを吸収して、恐怖の帝王に変身した! 怒りに震えるボーボボは、ついに鼻毛真拳の封印を解く! 破天荒は、電脳6闘騎士･王龍牙 (ワンロンガ) と激闘中! 今、サイバー都市での死闘に決着がつく!

ギガは、奥義を駆使するボーボボたちと、互角の戦いを繰りひろげていた。しかしヤツは、まだ奥義を使っていないと言う。驚くボーボボたちに、ついに“オブジェ真拳”奥義が炸裂する!

ボーボボたちは、ギガが送ってよこした棺桶に乗り、ギガ･ステーション最上階を目指す。ついにたどり着いた彼らに、無数の鉄球がいっせいに襲いかかる!

ソフトンを破ったJを倒すため“聖鼻毛融合 (ボーボボ･フュージョン)”! ところが突然現れた田楽マンが、首領パッチを押しのけボーボボと融合してしまう! 最強女 (?) 戦士･田ボちゃんの誕生だ!!

電脳6闘騎士総長･詩人 (しびと) のゴシック真拳最大奥義「記憶破壊陣」を受けて、天の助と魚雷ガールは、記憶すべてを破壊され、戦闘不能におちいってしまう。だが、元々記憶のない首領パッチには無効。反撃開始だ!